RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR6Q9Y217 621 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 STX6O43752 255 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RESTQ13127 1097 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 GRB10Q13322 594 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRSQ13332 1948 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 EPC2Q52LR7 807 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PADI6Q6TGC4 694 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD11Q96NU1 681 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DNM3Q9UQ16 869 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 GBF1Q92538 1859 aa23.45■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP15O95972 392 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP11B2P19099 503 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 POU5F1BQ06416 359 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TFDP1Q14186 410 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM192Q8IY95 271 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 DACT1Q9NYF0 836 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0U1RQF3 1178 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LPXNO60711 386 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GLRA2P23416 452 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PHKA2P46019 1235 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GATMP50440 423 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PTENP60484 403 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PPM1EQ8WY54 764 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 COL6A3P12111 3177 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 E9PMD0 336 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 BMPR1AP36894 532 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIC4Q9Y696 253 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC3P53804 2025 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 EYA4O95677 639 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 EOMESO95936 686 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00271P0C7V0 271 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFR1P11362 822 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPSQ13938 189 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 HYIQ5T013 277 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF169Q8NCN4 708 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 AK8Q96MA6 479 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 POLD4Q9HCU8 107 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BNC9 293 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 RB1P06400 928 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 GPM6BQ13491 265 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.344e-9■■■■■ 51.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA5Q96PV4 448 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PLIN2Q99541 437 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP4-204ENST00000416021 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA2O43364 376 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SKIP12755 728 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CTNNB1P35222 781 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN1Q05586 938 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPAQ15257 358 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNK18Q7Z418 384 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CABP7Q86V35 215 aa23.39■■□□□ 1.33
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