RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 GAB4Q2WGN9 574 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RASSF3Q86WH2 238 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 IPPKQ9H8X2 491 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CLEC1BQ9P126 229 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 INVSQ9Y283 1065 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 LCP1P13796 627 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 AKAP5P24588 427 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SCAND1P57086 179 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 EGR3Q06889 387 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ZNF174Q15697 407 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 MCTP1Q6DN14 999 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RUNDC1Q96C34 613 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 COG3Q96JB2 828 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TNIP3Q96KP6 325 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 BOCQ9BWV1 1114 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FAM50BQ9Y247 325 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 BTAF1O14981 1849 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PIK3C2AO00443 1686 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ARNTLO00327 626 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 BIN1O00499 593 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TGM5O43548 720 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 MYO1BO43795 1136 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA12O60330 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TCEA3O75764 348 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 IFNGR1P15260 489 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PAMP19021 973 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CTSKP43235 329 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GJA9P57773 515 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ADCY1Q08828 1119 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ACAP2Q15057 778 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CLUL1Q15846 466 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CCDC103Q8IW40 242 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CCDC120Q96HB5 630 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 MMP19Q99542 508 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PAPPAQ13219 1627 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SLC12A8A0AV02 714 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TBX3O15119 743 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 OFD1O75665 1012 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 BMP8BP34820 402 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GRK3P35626 688 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PHC1P78364 1004 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 HTRA3P83110 453 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 TERF2Q15554 542 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 GJA10Q969M2 543 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 HDAC8Q9BY41 377 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PALLDQ8WX93 1383 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-201ENST00000358813 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.73□□□□□ -1.33
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