RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CSADQ9Y600 493 aa17.58■□□□□ 0.41
GINS2-201ENST00000253462 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 KRT76Q01546 638 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FSTL1Q12841 308 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 EXOC3L4Q17RC7 722 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 TLR10Q9BXR5 811 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 WDR81Q562E7 1941 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 WDR90Q96KV7 1748 aa17.58■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 AGPSO00116 658 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 JAK3P52333 1124 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 CNTN2Q02246 1040 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 MAP9Q49MG5 647 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 OTUD5Q96G74 571 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GANQ9H2C0 597 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 IRF6O14896 467 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PON1P27169 355 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 C4orf19Q8IY42 314 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA5Q8TBA6 731 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GPRASP2Q96D09 838 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SYT17Q9BSW7 474 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PTPRFP10586 1907 aa17.57■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ATP2A1O14983 1001 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SOX10P56693 466 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SH3D19Q5HYK7 790 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ANO5Q75V66 913 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD35Q8N283 1001 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 BORCS6Q96GS4 357 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PACSIN1Q9BY11 444 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 MED4Q9NPJ6 270 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FTCDO95954 541 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 KCNA2P16389 499 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SFNP31947 248 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PEX3P56589 373 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 CCDC181Q5TID7 509 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GJB7Q6PEY0 223 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 MMGT1Q8N4V1 131 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ALS2CR12Q96Q35 445 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GCNT4Q9P109 453 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 BTBD7Q9P203 1132 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.56■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SLC16A4O15374 487 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 EXOC3O60645 756 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PPP1R37O75864 691 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 LYPLA2O95372 231 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 TRIM49P0CI25 452 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 TRIM49CP0CI26 452 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 UCHL3P15374 230 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 STRA6Q9BX79 667 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PLS3P13797 630 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 MCM3P25205 808 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 KLRC1P26715 233 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SPAG5Q96R06 1193 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PAGR1Q9BTK6 254 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 OTOFQ9HC10 1997 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 A0A087X0T9 212 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PJA2O43164 708 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 ZNF862O60290 1169 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 SERPING1P05155 500 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 FAM228BP0C875 321 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 PTPROQ16827 1216 aa17.55■□□□□ 0.4
GINS2-201ENST00000253462 GBP6Q6ZN66 633 aa17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms