RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000065330.7

Clk3-201, Transcript of Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clk3, Length 2,496 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3-201ENSMUST00000065330 Q3TTJ4 293 aa20.49■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Msantd2Q6NZR2 559 aa20.49■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Aipl1Q924K1 328 aa20.49■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa20.49■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fbf1A2A870 1173 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 GscQ02591 256 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Scfd2Q8BTY8 684 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Defb15Q8R2I5 79 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 AvenQ9D9K3 342 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Scn3aA2ASI5 1947 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Klra6Q60653 266 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Depdc1bQ8BH88 529 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cfap53Q9D439 514 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tlr5Q9JLF7 859 aa20.48■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Calb1P12658 261 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rit2P70425 217 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pick1Q62083 416 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sorbs1Q62417 1290 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Lilrb4Q64281 335 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fgd5Q80UZ0 1219 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Kat5Q8CHK4 513 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 GgcxQ9QYC7 757 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm3127E9Q9P5 263 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm3453K7N724 263 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Senp6Q6P7W0 1132 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sun2Q8BJS4 731 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Slc18a1Q8R090 521 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cog1Q9Z160 980 aa20.47■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Exoc4O35382 975 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ncf2O70145 525 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Epha3P29319 983 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Sox13Q04891 613 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Stxbp2Q64324 593 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tsga10Q6NY15 697 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ano5Q75UR0 904 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Raver2Q7TPD6 673 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ccdc134Q8C7V8 229 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Klhl36Q8R124 613 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 PhykplQ8R1K4 467 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Atp2a1Q8R429 994 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Arhgef25Q9CWR0 618 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Llcfc1Q9D9P8 108 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tjp3Q9QXY1 905 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Oip5A2AQ14 241 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Prl6a1O35257 230 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Stk10O55098 966 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Phf8Q80TJ7 1023 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Trim65Q8BFW4 522 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rassf2Q8BMS9 326 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Lrrc4cQ8C031 640 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Def6Q8C2K1 630 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gpsm2Q8VDU0 679 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Nmrk1Q91W63 195 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 GrapQ9CX99 217 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Extl3Q9WVL6 918 aa20.46■□□□□ 0.87
Clk3-201ENSMUST00000065330 Itgb5O70309 798 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rgs9bpQ148R9 237 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ints8Q80V86 995 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 FtoQ8BGW1 502 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Camkk2Q8C078 588 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Zfp446Q8C9M8 523 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Atp6v0a4Q920R6 833 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 NkapQ9D0F4 415 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Astn1Q61137 1302 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Vmn2r77L7N2B7 854 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pik3caP42337 1068 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Tmod1P49813 359 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 LxnP70202 222 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Cyp11b1Q3TG86 501 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Arhgap44Q5SSM3 814 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ppp1r13bQ62415 1087 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Baiap3Q80TT2 1134 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Lin9Q8C735 542 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Ccdc15Q8C9M2 810 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Nr3c2Q8VII8 978 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fmnl1Q9JL26 1094 aa20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Gm15448F6PZL4 682 aa20.44■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Pik3r1P26450 724 aa20.44■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Rnf113a2Q14B01 337 aa20.44■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Phactr1Q2M3X8 580 aa20.44■□□□□ 0.86
Clk3-201ENSMUST00000065330 Fam107bQ3TGF2 131 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms