Protein–RNA interactions for Protein: Q924K1

Aipl1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aipl1Q924K1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Aipl1Q924K1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Aipl1Q924K1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aipl1Q924K1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Aipl1Q924K1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Aipl1Q924K1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Aipl1Q924K1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Aipl1Q924K1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Aipl1Q924K1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Aipl1Q924K1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Aipl1Q924K1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Aipl1Q924K1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Aipl1Q924K1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Aipl1Q924K1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Aipl1Q924K1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Aipl1Q924K1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Aipl1Q924K1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Aipl1Q924K1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aipl1Q924K1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Aipl1Q924K1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Aipl1Q924K1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Aipl1Q924K1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Aipl1Q924K1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Aipl1Q924K1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Aipl1Q924K1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Aipl1Q924K1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Aipl1Q924K1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Aipl1Q924K1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Aipl1Q924K1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Aipl1Q924K1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aipl1Q924K1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Aipl1Q924K1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Aipl1Q924K1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Aipl1Q924K1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Aipl1Q924K1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Aipl1Q924K1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Aipl1Q924K1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Aipl1Q924K1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Aipl1Q924K1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Aipl1Q924K1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Aipl1Q924K1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Aipl1Q924K1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Aipl1Q924K1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Aipl1Q924K1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Aipl1Q924K1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Aipl1Q924K1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Aipl1Q924K1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Aipl1Q924K1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Aipl1Q924K1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Aipl1Q924K1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Aipl1Q924K1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aipl1Q924K1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aipl1Q924K1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aipl1Q924K1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aipl1Q924K1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Aipl1Q924K1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Aipl1Q924K1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aipl1Q924K1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Aipl1Q924K1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Aipl1Q924K1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aipl1Q924K1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aipl1Q924K1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aipl1Q924K1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aipl1Q924K1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Aipl1Q924K1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Aipl1Q924K1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aipl1Q924K1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aipl1Q924K1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aipl1Q924K1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aipl1Q924K1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aipl1Q924K1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aipl1Q924K1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aipl1Q924K1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aipl1Q924K1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Aipl1Q924K1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Aipl1Q924K1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Aipl1Q924K1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aipl1Q924K1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Aipl1Q924K1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aipl1Q924K1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aipl1Q924K1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aipl1Q924K1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aipl1Q924K1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Aipl1Q924K1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Aipl1Q924K1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aipl1Q924K1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Aipl1Q924K1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Aipl1Q924K1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Aipl1Q924K1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Aipl1Q924K1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aipl1Q924K1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aipl1Q924K1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aipl1Q924K1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aipl1Q924K1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aipl1Q924K1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aipl1Q924K1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aipl1Q924K1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aipl1Q924K1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aipl1Q924K1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aipl1Q924K1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms