RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA FMT1P32785 401 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA IML3P38265 245 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA UFE1P41834 346 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA NAS6P50086 228 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YGL114WP53134 725 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SPH1Q06160 661 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA AUS1Q08409 1394 aa2.21□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA VPS63O13549 108 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA CYM1P32898 989 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MYO3P36006 1272 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA FRM2P37261 193 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA HST4P53688 370 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA NRM1P53718 249 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA APC4Q04601 652 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MRX8Q05473 314 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YOL029CQ08187 201 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YDR018CQ12185 396 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YDR262WQ12331 272 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SPO24Q3E752 67 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RNR2P09938 399 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA CTA1P15202 515 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RBK1P25332 333 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA TAE1P38340 232 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA TRR2P38816 342 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA CAJ1P39101 391 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA NAS2P40555 220 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YIR035CP40579 254 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA TAF6P53040 516 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YGR016WP53209 190 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA HCH1P53834 153 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PRM7Q12459 698 aa2.2□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA ACB1P31787 87 aa2.19□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA HIT1P46973 164 aa2.19□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA INP2Q03824 705 aa2.19□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MHP1P43638 1398 aa2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.18□□□□□ -2.06not detected
15S_rRNA15S_rRNA KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SHE4P51534 789 aa2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA VTI1Q04338 217 aa2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA GMC1Q04399 608 aa2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PRM4Q12498 284 aa2.18□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA TPM1P17536 199 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA ITR2P30606 609 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MEI5P32489 222 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SKG6P32900 734 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YKL187CP34231 750 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MIC19P43594 170 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PGC1Q08959 321 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA APC2Q12440 853 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA FLO11P08640 1367 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SAL1D6W196 494 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA REP1P03871 373 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA VMA2P16140 517 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SMF2P38778 549 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RRG9P40156 214 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA ZRG17P53735 605 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YDR286CQ05530 114 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA BUR2Q05949 395 aa2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA GAL3P13045 520 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA COX10P21592 462 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA OPI1P21957 404 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA BUD2P33314 1104 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA PRY2P36110 329 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA BDH1P39714 382 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SDS23P53172 527 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA TPC1P53257 314 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA MGR3Q04472 501 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YPR195CQ06594 109 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YLR012CQ07927 99 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA YPS3Q12303 508 aa2.16□□□□□ -2.06
15S_rRNA15S_rRNA SRB2P34162 210 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA AST1P35183 429 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA RCK1P38622 512 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YIL054WP40524 105 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA PMT4P46971 762 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA INP1Q03694 420 aa2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CUP2P15315 225 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CTM1P38818 585 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA COS4P43542 379 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA CPR7P47103 393 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YGR168CP53293 376 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA ECM19Q06011 112 aa2.14□□□□□ -2.07
15S_rRNA15S_rRNA YDL211CQ12121 372 aa2.14□□□□□ -2.07
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