RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W MRX10Q05648 414 aa6.82□□□□□ -1.32
SPT15YER148W YPR084WQ06821 456 aa6.82□□□□□ -1.32
SPT15YER148W GUT2P32191 649 aa6.81□□□□□ -1.32
SPT15YER148W SIS2P36024 562 aa6.81□□□□□ -1.32
SPT15YER148W BDP1P46678 594 aa6.81□□□□□ -1.32
SPT15YER148W FRA1Q07825 749 aa6.81□□□□□ -1.32
SPT15YER148W AMS1P22855 1083 aa6.8□□□□□ -1.32
SPT15YER148W CST6P40535 587 aa6.8□□□□□ -1.32
SPT15YER148W YPR204WQ08995 1032 aa6.8□□□□□ -1.32
SPT15YER148W ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPT15YER148W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SPT15YER148W TTI1P36097 1038 aa6.77□□□□□ -1.33
SPT15YER148W EMP47P43555 445 aa6.77□□□□□ -1.33
SPT15YER148W ATG3P40344 310 aa6.76□□□□□ -1.33
SPT15YER148W APL6P46682 809 aa6.76□□□□□ -1.33
SPT15YER148W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SPT15YER148W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SPT15YER148W SSA4P22202 642 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SPT15YER148W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W KIP2P28743 706 aa6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W ISF1P32488 338 aa6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W PEP12P32854 288 aa6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W IXR1P33417 597 aa6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W PUS5Q06244 254 aa6.74□□□□□ -1.33
SPT15YER148W HED1Q03937 162 aa6.73□□□□□ -1.33
SPT15YER148W DNA2P38859 1522 aa6.71□□□□□ -1.33
SPT15YER148W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPT15YER148W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SPT15YER148W RAS1P01119 309 aa6.7□□□□□ -1.34
SPT15YER148W CPS1P27614 576 aa6.7□□□□□ -1.34
SPT15YER148W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPT15YER148W ENV9Q08651 330 aa6.7□□□□□ -1.34
SPT15YER148W DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPT15YER148W RTT106P40161 455 aa6.67□□□□□ -1.34
SPT15YER148W TGL4P36165 910 aa6.66□□□□□ -1.34
SPT15YER148W SOH1P38633 127 aa6.66□□□□□ -1.34
SPT15YER148W CDC4P07834 779 aa6.65□□□□□ -1.34
SPT15YER148W SSA1P10591 642 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPT15YER148W ITT1Q04638 464 aa6.65□□□□□ -1.34
SPT15YER148W ATG20Q07528 640 aa6.65□□□□□ -1.34
SPT15YER148W PUP1P25043 261 aa6.64□□□□□ -1.35
SPT15YER148W APP1P53933 587 aa6.64□□□□□ -1.35
SPT15YER148W FBP26P32604 452 aa6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W YBL086CP38177 466 aa6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W CLA4P48562 842 aa6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W MET32Q12041 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SPT15YER148W GAL2P13181 574 aa6.62□□□□□ -1.35
SPT15YER148W MKS1P34072 584 aa6.62□□□□□ -1.35
SPT15YER148W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SPT15YER148W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SPT15YER148W PHO87P25360 923 aa6.61□□□□□ -1.35
SPT15YER148W ISU1Q03020 165 aa6.61□□□□□ -1.35
SPT15YER148W STE6P12866 1290 aa6.6□□□□□ -1.35
SPT15YER148W AFT1P22149 690 aa6.6□□□□□ -1.35
SPT15YER148W GEF1P37020 779 aa6.6□□□□□ -1.35
SPT15YER148W KTR7P40504 517 aa6.6□□□□□ -1.35
SPT15YER148W YFL034WP43564 1073 aa6.6□□□□□ -1.35
SPT15YER148W HAP4P14064 554 aa6.59□□□□□ -1.35
SPT15YER148W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SPT15YER148W TSC13Q99190 310 aa6.59□□□□□ -1.35
SPT15YER148W KOG1P38873 1557 aa6.58□□□□□ -1.36
SPT15YER148W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SPT15YER148W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SPT15YER148W HDA3Q06623 655 aa6.58□□□□□ -1.36
SPT15YER148W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.58□□□□□ -1.36not detected
SPT15YER148W ECM23Q02710 187 aa6.57□□□□□ -1.36
SPT15YER148W GAS4Q08271 471 aa6.57□□□□□ -1.36
SPT15YER148W MIP1P15801 1254 aa6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W UTR2P32623 467 aa6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W ACS2P52910 683 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W YML083CQ04526 418 aa6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W DFG5Q05031 458 aa6.56□□□□□ -1.36
SPT15YER148W ASH1P34233 588 aa6.55□□□□□ -1.36
SPT15YER148W HST3P53687 447 aa6.55□□□□□ -1.36
SPT15YER148W BDS1Q08347 646 aa6.55□□□□□ -1.36
SPT15YER148W TRK1P12685 1235 aa6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W UGA3P26370 528 aa6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W SLX8P40072 274 aa6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W ROM1P53046 1155 aa6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SPT15YER148W UBP1P25037 809 aa6.52□□□□□ -1.37
SPT15YER148W TBS1P38114 1094 aa6.52□□□□□ -1.37
SPT15YER148W UBX7P38349 436 aa6.52□□□□□ -1.37
SPT15YER148W WTM2Q12206 467 aa6.52□□□□□ -1.37
SPT15YER148W SWR1Q05471 1514 aa6.51□□□□□ -1.37
SPT15YER148W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SPT15YER148W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SPT15YER148W NTH2P35172 780 aa6.51□□□□□ -1.37
SPT15YER148W SRC1Q03707 834 aa6.51□□□□□ -1.37
SPT15YER148W SWI5P08153 709 aa6.5□□□□□ -1.37
SPT15YER148W DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPT15YER148W ARG82P07250 355 aa6.49□□□□□ -1.37
SPT15YER148W VAN1P23642 535 aa6.49□□□□□ -1.37
SPT15YER148W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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