RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.28■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 PLXNC1O60486 1568 aa18.27■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.27■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.27■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.26■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.26■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.26■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.26■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.25■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.25■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 MSH5O43196 834 aa18.23■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC2Q92887 1545 aa18.23■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 A2MP01023 1474 aa18.23■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.21■□□□□ 0.51
C9orf170-201ENST00000623052 LAMC1P11047 1609 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.2■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.18■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 NUDCQ9Y266 331 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.17■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.16■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.15■□□□□ 0.5
C9orf170-201ENST00000623052 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.13■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC1P33527 1531 aa18.13■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ATP10AO60312 1499 aa18.13■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.12■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RGL3Q3MIN7 710 aa18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 ERBINQ96RT1 1412 aa18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TMC1Q8TDI8 760 aa18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.1■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 TESK2Q96S53 571 aa18.09■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PLCH2O75038 1416 aa18.09■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
C9orf170-201ENST00000623052 RALBP1Q15311 655 aa18.08■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.08■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 MADDQ8WXG6 1647 aa18.06■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.05■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 IQGAP1P46940 1657 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.04■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 CEP152O94986 1710 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 DEPDC5O75140 1603 aa18.02■□□□□ 0.48
C9orf170-201ENST00000623052 TRPM2O94759 1503 aa18■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CLTCL1P53675 1640 aa18■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP13Q86W25 1043 aa18■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 MYOM1P52179 1685 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf170-201ENST00000623052 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 PANK3Q9H999 370 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 TET3O43151 1660 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 PTPRTO14522 1441 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 MROH1Q8NDA8 1641 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 AFAP1Q8N556 730 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 CDCA7LQ96GN5 454 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 ATP7AQ04656 1500 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 TMF1P82094 1093 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 INSRP06213 1382 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 SYNMO15061 1565 aa17.89■□□□□ 0.46
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.89■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 RCAN3Q9UKA8 241 aa17.88■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.87■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.87■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.86■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 IFT172Q9UG01 1749 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 PDE3BQ13370 1112 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 FANCAO15360 1455 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ABCA6Q8N139 1617 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MROH2AA6NES4 1674 aa17.85■□□□□ 0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms