RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.87■□□□□ 0.29
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.83■□□□□ 0.28
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AFAP1Q8N556 730 aa16.74■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLXNC1O60486 1568 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERBINQ96RT1 1412 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TESK2Q96S53 571 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NLRP13Q86W25 1043 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PANK3Q9H999 370 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMF1P82094 1093 aa16.67■□□□□ 0.26
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCC1P33527 1531 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.63■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP10AO60312 1499 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF123Q5XPI4 1314 aa16.6■□□□□ 0.25
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.56■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FANCAO15360 1455 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.54■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.54■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDCA8Q53HL2 280 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP7AQ04656 1500 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTPRTO14522 1441 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.49■□□□□ 0.23
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 MADDQ8WXG6 1647 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLTCL1P53675 1640 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLIN1O60240 522 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP2R1AP30153 589 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASXL2Q76L83 1435 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STAC3Q96MF2 364 aa16.46■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.45■□□□□ 0.22
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