RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 TK2O00142 265 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-207ENST00000549400 KIF3CO14782 793 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-207ENST00000549400 TMC2Q8TDI7 906 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-207ENST00000549400 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 SLC34A2O95436 690 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 PSEN2P49810 448 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 PTPN5P54829 565 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 FBXO22Q8NEZ5 403 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
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PTPRB-207ENST00000549400 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 STK24Q9Y6E0 443 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 CUX1P39880 1505 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-207ENST00000549400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 CEP162Q5TB80 1403 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 RGS20O76081 388 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-207ENST00000549400 MFRPQ9BY79 579 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-207ENST00000549400 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRB-207ENST00000549400 STK25O00506 426 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRB-207ENST00000549400 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 KIF27Q86VH2 1401 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 TBC1D12O60347 775 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 VPS8Q8N3P4 1428 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 A0A0G2JS52 829 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 IFFO2Q5TF58 517 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 Q6ZNB5 142 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 WDR97A6NE52 1622 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-207ENST00000549400 IGSF3O75054 1194 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 PLPP6Q8IY26 295 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 CLIP1P30622 1438 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 WNT2BQ93097 391 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ARAP1Q96P48 1450 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 TOPBP1Q92547 1522 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 NEFLP07196 543 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 MAP3K1Q13233 1512 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-207ENST00000549400 PPP1R37O75864 691 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-207ENST00000549400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 CUL7Q14999 1698 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 FOXK1P85037 733 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 CUX2O14529 1486 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 PTPREP23469 700 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 PDE4CQ08493 712 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-207ENST00000549400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-207ENST00000549400 NESP48681 1621 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 DSG2Q14126 1118 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 NBPF3Q9H094 633 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 WDR62O43379 1518 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 SAMD9Q5K651 1589 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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