RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNJ1O43426 1573 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 G3V3G9 751 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 AAMPQ13685 434 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 CLSTN1O94985 981 aa12.39□□□□□ -0.43
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RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.37□□□□□ -0.43
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RABGGTB-214ENST00000497648 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.37□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.37□□□□□ -0.43
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RABGGTB-214ENST00000497648 IFT140Q96RY7 1462 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF3CO14782 793 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 TICAM2Q86XR7 235 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 SOGA1O94964 1423 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf72A6NCS6 295 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGGTB-214ENST00000497648 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.442e-27■■■■■ 28.2
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RABGGTB-214ENST00000497648 PBRM1Q86U86 1689 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 PDE4AP27815 886 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 TMC2Q8TDI7 906 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 CHD1O14646 1710 aa12.23□□□□□ -0.45
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RABGGTB-214ENST00000497648 MFSD10Q14728 455 aa12.22□□□□□ -0.45
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RABGGTB-214ENST00000497648 FOXK1P85037 733 aa12.21□□□□□ -0.45
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RABGGTB-214ENST00000497648 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGGTB-214ENST00000497648 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
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RABGGTB-214ENST00000497648 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
RABGGTB-214ENST00000497648 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.09□□□□□ -0.47
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RABGGTB-214ENST00000497648 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-214ENST00000497648 SYNJ2O15056 1496 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF592Q92610 1267 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC34A2O95436 690 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF27Q86VH2 1401 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 SNPHO15079 494 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR70Q9NW82 654 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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RABGGTB-214ENST00000497648 DOK7Q18PE1 504 aa12.04□□□□□ -0.48
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RABGGTB-214ENST00000497648 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 GRIN2AQ12879 1464 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 CUL7Q14999 1698 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 CEP170Q5SW79 1584 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGGTB-214ENST00000497648 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 IGF1RP08069 1367 aa12.02□□□□□ -0.49
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RABGGTB-214ENST00000497648 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR153Q6NV75 609 aa12□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 ST18O60284 1047 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 ZMYND15Q9H091 742 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.98□□□□□ -0.49
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