RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496507.1

RPS29P11-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P11, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P11-201ENST00000496507 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 ADAM33Q9BZ11 813 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa3.49□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 LCE2BO14633 110 aa3.48□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 JPH4Q96JJ6 628 aa3.48□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 PRDM2Q13029 1718 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 HS6ST3Q8IZP7 471 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.47□□□□□ -1.85
RPS29P11-201ENST00000496507 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 ZDHHC16Q969W1 377 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 NBPF3Q9H094 633 aa3.46□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 EVI5O60447 810 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 COL9A1P20849 921 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 BCAMP50895 628 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 PROX2Q3B8N5 592 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 Q6ZNB5 142 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 SOWAHBA6NEL2 793 aa3.44□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa3.44□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 ANKK1Q8NFD2 765 aa3.44□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa3.44□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 LAPTM4BQ86VI4 370 aa3.43□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 WBP1LQ9NX94 342 aa3.43□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa3.43□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCC8Q09428 1581 aa3.42□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 KCNC4Q03721 635 aa3.42□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 NYAP1Q6ZVC0 841 aa3.42□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 PDE4AP27815 886 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 MFSD10Q14728 455 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 LAPTM4AQ15012 233 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 EMILIN3Q9NT22 766 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 KIAA1468Q9P260 1216 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 SYNJ1O43426 1573 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 CFTRP13569 1480 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 WDR97A6NE52 1622 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS29P11-201ENST00000496507 GFRA3O60609 400 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TYW1BQ6NUM6 668 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 PHF14O94880 888 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CHGAP10645 457 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 MAP3K9P80192 1104 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 FBXW7Q969H0 707 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CUX1P39880 1505 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TJAP1Q5JTD0 557 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 HPS5Q9UPZ3 1129 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 WDR62O43379 1518 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CADPSQ9ULU8 1353 aa3.37□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CUX2O14529 1486 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 LRCH3Q96II8 777 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.36□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TOPBP1Q92547 1522 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TOP2BQ02880 1626 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CADPS2Q86UW7 1296 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 EPAS1Q99814 870 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 V9GY48 417 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CEP164Q9UPV0 1460 aa3.35□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 CAMK2BQ13554 666 aa3.34□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF787Q6DD87 383 aa3.34□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.34□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 TSKSQ9UJT2 592 aa3.34□□□□□ -1.87
RPS29P11-201ENST00000496507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 MRC2Q9UBG0 1479 aa3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 C3orf80F5H4A9 247 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PPP4CP60510 307 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF516Q92618 1163 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 MTRQ99707 1265 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 IL21Q9HBE4 155 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 FAM198AQ9UFP1 575 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms