RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.84■□□□□ 0.93
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C9orf3-218ENST00000482056 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.53■□□□□ 0.88
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C9orf3-218ENST00000482056 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.48■□□□□ 0.87
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C9orf3-218ENST00000482056 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.47■□□□□ 0.87
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C9orf3-218ENST00000482056 CDCA8Q53HL2 280 aa20.46■□□□□ 0.87
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C9orf3-218ENST00000482056 KANK1Q14678 1352 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf3-218ENST00000482056 TET3O43151 1660 aa20.44■□□□□ 0.86
C9orf3-218ENST00000482056 PTPRTO14522 1441 aa20.43■□□□□ 0.86
C9orf3-218ENST00000482056 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.42■□□□□ 0.86
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C9orf3-218ENST00000482056 SYNMO15061 1565 aa20.4■□□□□ 0.86
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C9orf3-218ENST00000482056 AFAP1Q8N556 730 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf3-218ENST00000482056 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf3-218ENST00000482056 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf3-218ENST00000482056 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf3-218ENST00000482056 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.38■□□□□ 0.85
C9orf3-218ENST00000482056 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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C9orf3-218ENST00000482056 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.36■□□□□ 0.85
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