RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 MAP7D2Q96T17 732 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRN-211ENST00000462351 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
PTPRN-211ENST00000462351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN-211ENST00000462351 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRN-211ENST00000462351 APBB1O00213 710 aa17.94■□□□□ 0.46
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PTPRN-211ENST00000462351 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.91■□□□□ 0.46
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PTPRN-211ENST00000462351 CCDC70Q6NSX1 233 aa17.89■□□□□ 0.45
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PTPRN-211ENST00000462351 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.88■□□□□ 0.45
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PTPRN-211ENST00000462351 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
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PTPRN-211ENST00000462351 FAM161AQ3B820 660 aa17.83■□□□□ 0.45
PTPRN-211ENST00000462351 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRN-211ENST00000462351 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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PTPRN-211ENST00000462351 PDE4CQ08493 712 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 KIF16BQ96L93 1317 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 SLC4A3P48751 1232 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 NPHP1O15259 732 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRN-211ENST00000462351 RALBP1Q15311 655 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 RASSF8Q8NHQ8 419 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.79■□□□□ 0.44
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PTPRN-211ENST00000462351 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.78■□□□□ 0.44
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PTPRN-211ENST00000462351 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.77■□□□□ 0.44
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PTPRN-211ENST00000462351 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRN-211ENST00000462351 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 HOMER1Q86YM7 354 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 TPM2P07951 284 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 GPATCH3Q96I76 525 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CDR1P51861 262 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 PES1O00541 588 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 TOPBP1Q92547 1522 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 SMC4Q9NTJ3 1288 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 NESP48681 1621 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRN-211ENST00000462351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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