RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OXER1Q8TDS5 423 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OCEL1Q9H607 264 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOPBP1Q92547 1522 aa14.27□□□□□ -0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FECHP22830 423 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX12PQ92771 950 aa14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D12O60347 775 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IER5LQ5T953 404 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCN6P51797 869 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CUX1P39880 1505 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTGDRQ13258 359 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCC8Q09428 1581 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARID3AQ99856 593 aa14.21□□□□□ -0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APBB1O00213 710 aa14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EVI5O60447 810 aa14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A1P11836 297 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.16□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NJR5 290 aa14.15□□□□□ -0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARID3CA6NKF2 412 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCG2P16885 1265 aa14.14□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNJ1O43426 1573 aa14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFT140Q96RY7 1462 aa14.12□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.12□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOGA1O94964 1423 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.11□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCN1P35523 988 aa14.09□□□□□ -0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAK2O60296 914 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOP2BQ02880 1626 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPAS1Q99814 870 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCM6Q14566 821 aa14.04□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF14O94880 888 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.02□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRCP23327 699 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POTEHQ6S545 545 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K7O43318 606 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC34A2O95436 690 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR97A6NE52 1622 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.96□□□□□ -0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC24BO95487 1268 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHOX2BQ99453 314 aa13.95□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.94□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAX1O00165 279 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.93□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.92□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OATP04181 439 aa13.91□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.91□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAD21O60216 631 aa13.9□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa13.9□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIN2BQ13224 1484 aa13.9□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PBRM1Q86U86 1689 aa13.9□□□□□ -0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXW7Q969H0 707 aa13.89□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHD1O14646 1710 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EVX2Q03828 476 aa13.87□□□□□ -0.19
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