RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 PRDM2Q13029 1718 aa20.53■□□□□ 0.88
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C9orf172-201ENST00000436881 MAPKBP1O60336 1514 aa20.5■□□□□ 0.87
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C9orf172-201ENST00000436881 HSCBQ8IWL3 235 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.36■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 E9PSI1 815 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 PDE4AP27815 886 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf172-201ENST00000436881 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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C9orf172-201ENST00000436881 APAF1O14727 1248 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf172-201ENST00000436881 AKNAQ7Z591 1439 aa20.32■□□□□ 0.84
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C9orf172-201ENST00000436881 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
C9orf172-201ENST00000436881 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C9orf172-201ENST00000436881 DAPK1P53355 1430 aa20.29■□□□□ 0.84
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C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
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C9orf172-201ENST00000436881 ROCK1Q13464 1354 aa20.26■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 IQGAP2Q13576 1575 aa20.26■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 NUTM2FA1L443 756 aa20.25■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 APBB1O00213 710 aa20.25■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 COG3Q96JB2 828 aa20.24■□□□□ 0.83
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C9orf172-201ENST00000436881 FGD1P98174 961 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 HMMRO75330 724 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.21■□□□□ 0.83
C9orf172-201ENST00000436881 SLC4A3P48751 1232 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 CRBNQ96SW2 442 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 USP35Q9P2H5 1018 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.2■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.19■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.18■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 RUNDC1Q96C34 613 aa20.17■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 PTPRKQ15262 1439 aa20.16■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.16■□□□□ 0.82
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