RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 HSCBQ8IWL3 235 aa20.57■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.56■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 COG6Q9Y2V7 657 aa20.56■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 PLCB2Q00722 1185 aa20.55■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 AFAP1Q8N556 730 aa20.54■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.54■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 CUX1P39880 1505 aa20.54■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.52■□□□□ 0.88
SYT6-201ENST00000369547 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.52■□□□□ 0.87
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SYT6-201ENST00000369547 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.5■□□□□ 0.87
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SYT6-201ENST00000369547 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.48■□□□□ 0.87
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SYT6-201ENST00000369547 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.47■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.46■□□□□ 0.87
SYT6-201ENST00000369547 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SYT6-201ENST00000369547 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SYT6-201ENST00000369547 WDR97A6NE52 1622 aa20.43■□□□□ 0.86
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SYT6-201ENST00000369547 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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SYT6-201ENST00000369547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SYT6-201ENST00000369547 E9PSI1 815 aa20.4■□□□□ 0.86
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SYT6-201ENST00000369547 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.37■□□□□ 0.85
SYT6-201ENST00000369547 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYT6-201ENST00000369547 TOPBP1Q92547 1522 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYT6-201ENST00000369547 TIAM1Q13009 1591 aa20.33■□□□□ 0.84
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SYT6-201ENST00000369547 STK31Q9BXU1 1019 aa20.32■□□□□ 0.84
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SYT6-201ENST00000369547 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.32■□□□□ 0.84
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SYT6-201ENST00000369547 RIPK4P57078 832 aa20.3■□□□□ 0.84
SYT6-201ENST00000369547 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SYT6-201ENST00000369547 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYT6-201ENST00000369547 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYT6-201ENST00000369547 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.28■□□□□ 0.84
SYT6-201ENST00000369547 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.27■□□□□ 0.84
SYT6-201ENST00000369547 MCCP23508 829 aa20.27■□□□□ 0.83
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SYT6-201ENST00000369547 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.25■□□□□ 0.83
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SYT6-201ENST00000369547 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.25■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 OSCARQ8IYS5 282 aa20.25■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 COG3Q96JB2 828 aa20.25■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.24■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 GBP4Q96PP9 640 aa20.24■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 EID1Q9Y6B2 187 aa20.23■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 RUNDC1Q96C34 613 aa20.23■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 BCAR3O75815 825 aa20.22■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.21■□□□□ 0.83
SYT6-201ENST00000369547 LNPKQ9C0E8 428 aa20.2■□□□□ 0.82
SYT6-201ENST00000369547 SKAP1Q86WV1 359 aa20.2■□□□□ 0.82
SYT6-201ENST00000369547 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.2■□□□□ 0.82
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