RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 LAMC1P11047 1609 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 MSH5O43196 834 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 PLXNC1O60486 1568 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 SHROOM2Q13796 1616 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 RALBP1Q15311 655 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXD1-201ENST00000331462 TMC1Q8TDI8 760 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2R1Q13018 1463 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 ATP10AO60312 1499 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 A2MP01023 1474 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXD1-201ENST00000331462 CHD1O14646 1710 aa30.45■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC2Q92887 1545 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXD1-201ENST00000331462 ERBINQ96RT1 1412 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 INSRP06213 1382 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP13Q86W25 1043 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
HOXD1-201ENST00000331462 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD1-201ENST00000331462 TESK2Q96S53 571 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD1-201ENST00000331462 PDE3BQ13370 1112 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 PLCH2O75038 1416 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC1P33527 1531 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 RGL3Q3MIN7 710 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
HOXD1-201ENST00000331462 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXD1-201ENST00000331462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
HOXD1-201ENST00000331462 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD1-201ENST00000331462 MADDQ8WXG6 1647 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXD1-201ENST00000331462 IQGAP1P46940 1657 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 TMF1P82094 1093 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM2O94759 1503 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 DEPDC5O75140 1603 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD1-201ENST00000331462 CEP152O94986 1710 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 PANK3Q9H999 370 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRTO14522 1441 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 STAC3Q96MF2 364 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 SYNMO15061 1565 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXD1-201ENST00000331462 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 TET3O43151 1660 aa30■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 CLTCL1P53675 1640 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 OSCARQ8IYS5 282 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXD1-201ENST00000331462 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 CDCA8Q53HL2 280 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
HOXD1-201ENST00000331462 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.9■■■□□ 2.38
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