RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

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Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 MYBPC2Q14324 1141 aa9.19□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 POTEDQ86YR6 584 aa9.18□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 MORC4Q8TE76 937 aa9.18□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.18□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 RAB11FIP3O75154 756 aa9.17□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 MTA3Q9BTC8 594 aa9.17□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 ERCC6Q03468 1493 aa9.17□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.17□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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RRN3-202ENST00000327307 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 PEX14O75381 377 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 MMP14P50281 582 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 EVI5LQ96CN4 794 aa9.15□□□□□ -0.94
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RRN3-202ENST00000327307 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3-202ENST00000327307 SMARCA2P51531 1590 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 HMGXB3Q12766 1538 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 TTC36A6NLP5 189 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 CCER2I3L3R5 266 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 PPFIA4O75335 1185 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 FOSBP53539 338 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
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RRN3-202ENST00000327307 NBPF11Q86T75 865 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 STAC3Q96MF2 364 aa9.13□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 AK7Q96M32 723 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3-202ENST00000327307 SMARCA4P51532 1647 aa9.11□□□□□ -0.95
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RRN3-202ENST00000327307 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.09□□□□□ -0.95
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RRN3-202ENST00000327307 SMC5Q8IY18 1101 aa9.09□□□□□ -0.95
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RRN3-202ENST00000327307 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 UBXN4Q92575 508 aa9.08□□□□□ -0.96
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RRN3-202ENST00000327307 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
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RRN3-202ENST00000327307 NESP48681 1621 aa9.07□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 SOX12O15370 315 aa9.06□□□□□ -0.96
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RRN3-202ENST00000327307 C8orf37Q96NL8 207 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 PNMA2Q9UL42 364 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 CCDC181Q5TID7 509 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 LIG1P18858 919 aa9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 CEP120Q8N960 986 aa9.05□□□□□ -0.96
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RRN3-202ENST00000327307 PAX3P23760 479 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 SEMA3EO15041 775 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 KIF4AO95239 1232 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 APLP1P51693 650 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 PDE4DQ08499 809 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 SSFA2P28290 1259 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 MAF1Q9H063 256 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 MCM6Q14566 821 aa9.01□□□□□ -0.97
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