RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 MORC1Q86VD1 984 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.6■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.59■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 APAF1O14727 1248 aa19.58■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.58■□□□□ 0.73
KCNS1-201ENST00000306117 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 APBB1O00213 710 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 COG6Q9Y2V7 657 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 KCNJ4P48050 445 aa19.57■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FGD1P98174 961 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FAM161AQ3B820 660 aa19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PTMSP20962 102 aa19.55■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NFKBIBQ15653 356 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.54■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 PLEKHG5O94827 1062 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 JPH4Q96JJ6 628 aa19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NESP48681 1621 aa19.52■□□□□ 0.72
KCNS1-201ENST00000306117 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 PTPRKQ15262 1439 aa19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.5■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 BACH2Q9BYV9 841 aa19.49■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 STK26Q9P289 416 aa19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.48■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 MCCP23508 829 aa19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 ERCC6Q03468 1493 aa19.46■□□□□ 0.71
KCNS1-201ENST00000306117 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.45■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 GGT6Q6P531 493 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 PANK1Q8TE04 598 aa19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.43■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 KIF3BO15066 747 aa19.42■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.41■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 POGKQ9P215 609 aa19.41■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 C14orf37Q86TY3 774 aa19.4■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
KCNS1-201ENST00000306117 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 BCAR3O75815 825 aa19.39■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 SOX12O15370 315 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP44Q96MT7 982 aa19.38■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 NCOA1Q15788 1441 aa19.37■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 PRDM2Q13029 1718 aa19.35■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 TOPBP1Q92547 1522 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 E9PSI1 815 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.33■□□□□ 0.69
KCNS1-201ENST00000306117 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.33■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.32■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 DAPK1P53355 1430 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PPP2R1AP30153 589 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.31■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 MAP3K1Q13233 1512 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.3■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 KANK1Q14678 1352 aa19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms