RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PREX2Q70Z35 1606 aa23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NFKBIBQ15653 356 aa23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MBD5Q9P267 1494 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRL2O95490 1459 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLCH2O75038 1416 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSPY4P0CV99 314 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSPY10P0CW01 314 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ASXL2Q76L83 1435 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMC1Q8TDI8 760 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE3BQ13370 1112 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF15Q9NS87 1388 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXD1Q16676 465 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC1P33527 1531 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP47Q96K76 1375 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PZPP20742 1482 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM5CP41229 1560 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FANCAO15360 1455 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RALBP1Q15311 655 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC4A3P48751 1232 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AFAP1Q8N556 730 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUP155O75694 1391 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLXNC1O60486 1568 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM161AQ3B820 660 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 E9PCH4 1651 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 INSRP06213 1382 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.27■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PKD2Q13563 968 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CRBNQ96SW2 442 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CD109Q6YHK3 1445 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRL1O94910 1474 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C8orf34Q49A92 452 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SKAP1Q86WV1 359 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms