RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 USP35Q9P2H5 1018 aa22.04■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.04■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 DAPK1P53355 1430 aa22.02■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 RAPGEF3O95398 923 aa22.02■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 RALBP1Q15311 655 aa22.02■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.01■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 SCAPERQ9BY12 1400 aa22■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2FA1L443 756 aa22■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.99■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 PANK3Q9H999 370 aa21.99■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 WDR97A6NE52 1622 aa21.98■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.97■■□□□ 1.11
TRPC1-201ENST00000273482 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.17e-6■■■□□ 16.5
TRPC1-201ENST00000273482 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 NLRP13Q86W25 1043 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC7Q96M83 1385 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 PDE3BQ13370 1112 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K1Q13233 1512 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.93■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 SLC4A3P48751 1232 aa21.93■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.93■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.92■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC5O15440 1437 aa21.91■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC184Q52MB2 194 aa21.91■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 PLIN1O60240 522 aa21.9■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 GSE1Q14687 1217 aa21.89■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.89■■□□□ 1.1
TRPC1-201ENST00000273482 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0G2JS52 829 aa21.88■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.87■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.87■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.86■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 MS4A1P11836 297 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.84■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRKQ15262 1439 aa21.84■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.84■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 EID1Q9Y6B2 187 aa21.83■■□□□ 1.09
TRPC1-201ENST00000273482 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 CRBNQ96SW2 442 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 ROCK1Q13464 1354 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 IL27Q8NEV9 243 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 NCOA1Q15788 1441 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 ATP10BO94823 1461 aa21.79■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.79■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 AKNAQ7Z591 1439 aa21.78■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 ADAMTS12P58397 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.78■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA2Q08379 1002 aa21.77■■□□□ 1.08
TRPC1-201ENST00000273482 FAM161AQ3B820 660 aa21.76■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.75■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.74■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.72■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.72■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CD109Q6YHK3 1445 aa21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 HSCBQ8IWL3 235 aa21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 EVC2Q86UK5 1308 aa21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 NFKBIBQ15653 356 aa21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 KIF14Q15058 1648 aa21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TRPC1-201ENST00000273482 WDR62O43379 1518 aa21.7■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.69■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.68■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.66■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 CABP2Q9NPB3 220 aa21.66■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.65■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.65■■□□□ 1.06
TRPC1-201ENST00000273482 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.65■■□□□ 1.06
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