RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267260.4

SRRM4-201, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM4, Length 8,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4-201ENST00000267260 MARCH6O60337 910 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRM4-201ENST00000267260 BECN2A8MW95 431 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRM4-201ENST00000267260 APBB1O00213 710 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRM4-201ENST00000267260 ZNF592Q92610 1267 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRM4-201ENST00000267260 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRM4-201ENST00000267260 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.88□□□□□ -0.03
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SRRM4-201ENST00000267260 H0YHG0 523 aa14.86□□□□□ -0.03
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SRRM4-201ENST00000267260 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRRM4-201ENST00000267260 FBXO3Q9UK99 471 aa14.81□□□□□ -0.04
SRRM4-201ENST00000267260 MYO6Q9UM54 1294 aa14.81□□□□□ -0.04
SRRM4-201ENST00000267260 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
SRRM4-201ENST00000267260 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.8□□□□□ -0.04
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SRRM4-201ENST00000267260 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.8□□□□□ -0.04
SRRM4-201ENST00000267260 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
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SRRM4-201ENST00000267260 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
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SRRM4-201ENST00000267260 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.78□□□□□ -0.04
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SRRM4-201ENST00000267260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
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SRRM4-201ENST00000267260 ROCK1Q13464 1354 aa14.73□□□□□ -0.05
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SRRM4-201ENST00000267260 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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SRRM4-201ENST00000267260 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SRRM4-201ENST00000267260 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.67□□□□□ -0.06
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