RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 NPHP1O15259 732 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 KIF3AQ9Y496 699 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 CUL7Q14999 1698 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 WWC1Q8IX03 1113 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 E9PSI1 815 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 HFM1A2PYH4 1435 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.31□□□□□ -0.6
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PTPRB-201ENST00000261266 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 PHF14O94880 888 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.3□□□□□ -0.6
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PTPRB-201ENST00000261266 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 PRDM2Q13029 1718 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRB-201ENST00000261266 MAP3K1Q13233 1512 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTPRB-201ENST00000261266 ARXQ96QS3 562 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRB-201ENST00000261266 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
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PTPRB-201ENST00000261266 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 ST18O60284 1047 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 STK26Q9P289 416 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 COG3Q96JB2 828 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 PRXQ9BXM0 1461 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRB-201ENST00000261266 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRB-201ENST00000261266 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRB-201ENST00000261266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.22□□□□□ -0.61
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PTPRB-201ENST00000261266 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRB-201ENST00000261266 DAPK1P53355 1430 aa11.21□□□□□ -0.61
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PTPRB-201ENST00000261266 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC7Q96M83 1385 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 KIF16BQ96L93 1317 aa11.2□□□□□ -0.62
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PTPRB-201ENST00000261266 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 FAM161AQ3B820 660 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRB-201ENST00000261266 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 RUNDC1Q96C34 613 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 GNAI1P63096 354 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 REC8O95072 547 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRB-201ENST00000261266 PLCB2Q00722 1185 aa11.14□□□□□ -0.63
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