RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.41■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 EVA1CP58658 441 aa20.4■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 KIF3AQ9Y496 699 aa20.4■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
LAMC1-201ENST00000258341 EID1Q9Y6B2 187 aa20.38■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 ST18O60284 1047 aa20.36■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.36■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.36■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.35■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 FOXD1Q16676 465 aa20.35■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 PRDM2Q13029 1718 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 TPM1P09493 284 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 NUTM2FA1L443 756 aa20.34■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 RILPL2Q969X0 211 aa20.33■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
LAMC1-201ENST00000258341 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.32■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.31■□□□□ 0.84
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LAMC1-201ENST00000258341 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 FBXW7Q969H0 707 aa20.3■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.29■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 MCTP1Q6DN14 999 aa20.29■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 PKD2Q13563 968 aa20.28■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 VPS37DQ86XT2 251 aa20.28■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.28■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.27■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.27■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 NGEFQ8N5V2 710 aa20.27■□□□□ 0.84
LAMC1-201ENST00000258341 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 RALBP1Q15311 655 aa20.24■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 BECN2A8MW95 431 aa20.24■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM29Q14134 588 aa20.23■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 APPP05067 770 aa20.23■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.22■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 GPS2Q13227 327 aa20.21■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
LAMC1-201ENST00000258341 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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LAMC1-201ENST00000258341 ODF2Q5BJF6 829 aa20.19■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF592Q92610 1267 aa20.19■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CCER2I3L3R5 266 aa20.18■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.18■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.18■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.17■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.17■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 NUP155O75694 1391 aa20.17■□□□□ 0.82
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LAMC1-201ENST00000258341 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.16■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CUX2O14529 1486 aa20.15■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.15■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.15■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.15■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.14■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
LAMC1-201ENST00000258341 KIF3BO15066 747 aa20.13■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.13■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 NACADO15069 1562 aa20.13■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.13■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 ERICH2A1L162 156 aa20.12■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 EPS15P42566 896 aa20.11■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 TEFQ10587 303 aa20.11■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.11■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 TRDNQ13061 729 aa20.1■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.09■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 NECTIN2Q92692 538 aa20.09■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.09■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 HOMER1Q86YM7 354 aa20.09■□□□□ 0.81
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