RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000195173.8

SEMA5B-201, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SEMA5B, Length 4,523 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-201ENST00000195173 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.68
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SEMA5B-201ENST00000195173 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.32■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 NCOA1Q15788 1441 aa19.32■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.31■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 JPH4Q96JJ6 628 aa19.31■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.3■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.3■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.29■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.29■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.28■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.28■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.27■□□□□ 0.68
SEMA5B-201ENST00000195173 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.26■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.26■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 NESP48681 1621 aa19.25■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 PANK1Q8TE04 598 aa19.25■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.25■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.24■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 E9PSI1 815 aa19.24■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.24■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.22■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.22■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
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SEMA5B-201ENST00000195173 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.21■□□□□ 0.67
SEMA5B-201ENST00000195173 HMGXB3Q12766 1538 aa19.2■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 DAPK1P53355 1430 aa19.2■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 BCAR3O75815 825 aa19.2■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
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SEMA5B-201ENST00000195173 APBB1O00213 710 aa19.19■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 ERCC6Q03468 1493 aa19.19■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 STK26Q9P289 416 aa19.18■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 POGKQ9P215 609 aa19.18■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.18■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 PRDM2Q13029 1718 aa19.17■□□□□ 0.66
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SEMA5B-201ENST00000195173 PPP2R1AP30153 589 aa19.17■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 KIF3BO15066 747 aa19.17■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.16■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 GBP4Q96PP9 640 aa19.16■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.15■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.15■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 GGT6Q6P531 493 aa19.15■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 ARID3AQ99856 593 aa19.14■□□□□ 0.66
SEMA5B-201ENST00000195173 KANK1Q14678 1352 aa19.14■□□□□ 0.65
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SEMA5B-201ENST00000195173 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 PLCB2Q00722 1185 aa19.12■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 CASC1Q6TDU7 716 aa19.12■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 ABCC5O15440 1437 aa19.1■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.1■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.08■□□□□ 0.65
SEMA5B-201ENST00000195173 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.08■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 ROCK1Q13464 1354 aa19.07■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.05■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.04■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.04■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.04■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.03■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.03■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.03■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.02■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 SOX12O15370 315 aa19.02■□□□□ 0.64
SEMA5B-201ENST00000195173 HECW1Q76N89 1606 aa19.02■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 PLEKHG5O94827 1062 aa19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 LNPKQ9C0E8 428 aa19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 RUNDC1Q96C34 613 aa18.99■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 PTPRGP23470 1445 aa18.99■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.99■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 SLFN5Q08AF3 891 aa18.99■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 TRAK2O60296 914 aa18.97■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 PDE3AQ14432 1141 aa18.97■□□□□ 0.63
SEMA5B-201ENST00000195173 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
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