RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uggt2E9Q4X2 1504 aa33.07■■■□□ 2.88
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plch2A2AP18 1501 aa33.03■■■□□ 2.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa33.03■■■□□ 2.88
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo41Q6NS60 873 aa32.98■■■□□ 2.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Naip5Q9R016 1403 aa32.98■■■□□ 2.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pip4k2bQ80XI4 416 aa32.96■■■□□ 2.87
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl9Q9D219 1425 aa32.95■■■□□ 2.87
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il16O54824 1322 aa32.91■■■□□ 2.86
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa32.88■■■□□ 2.85
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa32.85■■■□□ 2.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ssh2Q5SW75 1423 aa32.82■■■□□ 2.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myo5cE9Q1F5 1742 aa32.82■■■□□ 2.84
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcc6Q9R1S7 1498 aa32.78■■■□□ 2.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa32.78■■■□□ 2.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa32.78■■■□□ 2.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ShprhQ7TPQ3 1674 aa32.76■■■□□ 2.84
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps8Q0P5W1 1427 aa32.7■■■□□ 2.83
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rims2Q9EQZ7 1530 aa32.59■■■□□ 2.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ecm2Q5FW85 670 aa32.57■■■□□ 2.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde4cQ3UEI1 686 aa32.56■■■□□ 2.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akap12Q9WTQ5 1684 aa32.56■■■□□ 2.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AlkP97793 1621 aa32.55■■■□□ 2.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa32.5■■■□□ 2.79
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa32.38■■■□□ 2.77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif13aQ9EQW7 1749 aa32.37■■■□□ 2.77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clstn2Q9ER65 966 aa32.37■■■□□ 2.77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc21bQ0HA38 1315 aa32.33■■■□□ 2.77
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp644E9QA22 1323 aa32.32■■■□□ 2.76
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hspa1lP16627 641 aa32.3■■■□□ 2.76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccer2J3QPU5 274 aa32.29■■■□□ 2.76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AnkarA2RT91 1465 aa32.29■■■□□ 2.76
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa32.28■■■□□ 2.76
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa32.26■■■□□ 2.75
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Skint5A7XUY5 1461 aa32.25■■■□□ 2.75
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ino80Q6ZPV2 1559 aa32.24■■■□□ 2.75
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myom3A2ABU4 1439 aa32.19■■■□□ 2.74
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Txndc2Q6P902 515 aa32.19■■■□□ 2.74
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttll5Q8CHB8 1328 aa32.17■■■□□ 2.74
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nsd2Q8BVE8 1365 aa32.16■■■□□ 2.74
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa32.15■■■□□ 2.74
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Naip7Q9JIB3 1402 aa32.13■■■□□ 2.73
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mphosph9A6H5Y1 991 aa32.12■■■□□ 2.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl11bQ99PV8 884 aa32.12■■■□□ 2.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Efcab6Q6P1E8 1516 aa32.11■■■□□ 2.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd109Q8R422 1442 aa32.1■■■□□ 2.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Iqgap3F8VQ29 1632 aa32.1■■■□□ 2.73
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setd1aE9PYH6 1716 aa32.09■■■□□ 2.73
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P3h3Q8CG70 732 aa32.06■■■□□ 2.72
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