RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025421.7

Seh1l-201, Transcript of Nucleoporin SEH1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Seh1l, Length 3,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cd109Q8R422 1442 aa21.91■■□□□ 1.1
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Supt16hQ920B9 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 ArxO35085 564 aa21.88■■□□□ 1.09
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Esx1O88933 382 aa21.87■■□□□ 1.09
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Arhgef11Q68FM7 1552 aa21.86■■□□□ 1.09
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rock2P70336 1388 aa21.85■■□□□ 1.09
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ncoa1P70365 1447 aa21.84■■□□□ 1.09
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa21.83■■□□□ 1.08
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Znf608Q56A10 1511 aa21.82■■□□□ 1.08
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dbr1Q923B1 550 aa21.82■■□□□ 1.08
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ssh2Q5SW75 1423 aa21.81■■□□□ 1.08
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gcc2Q8CHG3 1679 aa21.78■■□□□ 1.08
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.76■■□□□ 1.07
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pik3c2gO70167 1506 aa21.75■■□□□ 1.07
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 L3mbtl2P59178 703 aa21.75■■□□□ 1.07
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Znf316Q6PGE4 1016 aa21.74■■□□□ 1.07
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zscan21Q07231 555 aa21.73■■□□□ 1.07
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Atp10dQ8K2X1 1416 aa21.73■■□□□ 1.07
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Atp7aQ64430 1491 aa21.72■■□□□ 1.07
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Usp40Q8BWR4 1235 aa21.72■■□□□ 1.07
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fancd2Q80V62 1450 aa21.71■■□□□ 1.07
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa21.7■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zscan10Q3URR7 782 aa21.68■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plin1Q8CGN5 517 aa21.68■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rusc2Q80U22 1514 aa21.67■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa21.66■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tmf1B9EKI3 1091 aa21.65■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa21.65■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa21.64■■□□□ 1.06
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa21.64■■□□□ 1.05
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 PrxO55103 1391 aa21.63■■□□□ 1.05
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa21.61■■□□□ 1.05
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abcc1O35379 1528 aa21.6■■□□□ 1.05
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kif7B7ZNG0 1348 aa21.59■■□□□ 1.05
Seh1l-201ENSMUST00000025421 NgefQ8CHT1 710 aa21.59■■□□□ 1.05
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plekhg5Q66T02 1073 aa21.58■■□□□ 1.05
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fam184bQ0KK56 942 aa21.57■■□□□ 1.04
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mink1Q9JM52 1308 aa21.56■■□□□ 1.04
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Caskin1Q6P9K8 1431 aa21.52■■□□□ 1.04
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cul7Q8VE73 1689 aa21.51■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa21.51■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Prdm16A2A935 1275 aa21.5■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Shq1Q7TMX5 569 aa21.5■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ttc21bQ0HA38 1315 aa21.49■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q9D9H8 365 aa21.48■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Asxl1P59598 1514 aa21.48■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Map3k4O08648 1597 aa21.48■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 AI481877A2ALV5 1481 aa21.48■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa21.47■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 4933416C03RikQ3V063 378 aa21.47■■□□□ 1.03
Seh1l-201ENSMUST00000025421 IqubQ8CDK3 788 aa21.47■■□□□ 1.03
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Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pprc1Q6NZN1 1644 aa21.45■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Camsap2Q8C1B1 1461 aa21.45■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Naip6Q9JIB6 1403 aa21.45■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tarbp1E9Q368 1579 aa21.44■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 ChgaP26339 463 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Znf330Q922H9 316 aa21.44■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 DaxxO35613 739 aa21.43■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Apaf1O88879 1249 aa21.43■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa21.43■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rock1P70335 1354 aa21.42■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Erbb3Q61526 1339 aa21.42■■□□□ 1.02
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