RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Pde4cQ3UEI1 686 aa14.89□□□□□ -0.03
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Magi3Q9EQJ9 1476 aa14.87□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 EspnQ9ET47 871 aa14.86□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kif16bB1AVY7 1312 aa14.86□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa14.86□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dnai1Q8C0M8 701 aa14.86□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Plin1Q8CGN5 517 aa14.86□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pank1Q8K4K6 548 aa14.86□□□□□ -0.03
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Peg3Q3URU2 1571 aa14.85□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Camsap2Q8C1B1 1461 aa14.85□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rfx7F8VPJ6 1459 aa14.85□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mug2P28666 1451 aa14.85□□□□□ -0.03
Herc4-201ENSMUST00000020258 Usp40Q8BWR4 1235 aa14.85□□□□□ -0.03
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccdc30Q8BVF4 654 aa14.82□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa14.82□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam163aQ8CAA5 168 aa14.82□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wdr7Q920I9 1489 aa14.82□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Neo1P97798 1493 aa14.81□□□□□ -0.04
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Ksr2Q3UVC0 959 aa14.8□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Iqcf3Q9D498 203 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa14.79□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arhgap5P97393 1501 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Irx3P81067 507 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Prex2Q3LAC4 1598 aa14.78□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adcy10Q8C0T9 1614 aa14.77□□□□□ -0.04
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppm1gQ61074 542 aa14.77□□□□□ -0.04
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf316Q6PGE4 1016 aa14.76□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trappc8E9PWG2 1437 aa14.76□□□□□ -0.05
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Lemd3Q9WU40 921 aa14.75□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmco5bQ80X59 307 aa14.75□□□□□ -0.05
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Herc4-201ENSMUST00000020258 SphkapQ6NSW3 1687 aa14.74□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pprc1Q6NZN1 1644 aa14.73□□□□□ -0.05
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Shroom2A2ALU4 1481 aa14.73□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gas2l2Q5SSG4 860 aa14.72□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ipo8Q7TMY7 1010 aa14.71□□□□□ -0.05
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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Herc4-201ENSMUST00000020258 Nutm1Q8BHP2 1126 aa14.71□□□□□ -0.05
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