RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS55P47111 140 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TAH11P47112 604 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HAM1P47119 197 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR098CP47139 656 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GET1P53192 235 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RCF2P53721 224 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MET14Q02196 202 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PET117Q02771 107 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PET191Q02772 108 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NCE101Q02820 53 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RVB1Q03940 463 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YHP1Q04116 353 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B VBA4Q04602 768 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B COG8Q04632 607 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SMA2Q04658 369 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR283WQ05867 314 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ECI1Q05871 280 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ASR1Q06834 288 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL216WQ08964 1102 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TSC13Q99190 310 aa0.51□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YAL064W-BO13512 126 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRP3P00937 484 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-LR1P0C2J4 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-FP0CX61 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-GR2P0CX62 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AMS1P22855 1083 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SCO1P23833 295 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SLM5P25345 492 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SUR1P33300 382 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PRX1P34227 261 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PTC1P35182 281 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data0.5□□□□□ -2.33not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B ECM33P38248 429 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MSG5P38590 489 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NSG1P38837 291 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HXT6P39003 570 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SMB1P40018 196 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MEP1P40260 492 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SIM1P40472 476 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BMT5P40493 336 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CAB2P40506 365 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC40P40968 455 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B UPF3P48412 387 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B LYS20P48570 428 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TAF6P53040 516 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR126WP53274 230 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RNH70P53331 553 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL260CP53846 198 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B COX12Q01519 83 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-DR2Q03483 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SHE9Q04172 456 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CAC2Q04199 468 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B FAL1Q12099 399 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B DCS2Q12123 353 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-BQ12260 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-OR2Q12293 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ZRT2Q12436 422 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-OR1Q12439 438 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RTN2Q12443 393 aa0.5□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BI2P03873 423 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B STE7P06784 515 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC12P11655 471 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B BAR1P12630 587 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CBS2P14905 389 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AAC3P18238 307 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ART10P18634 518 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MCK1P21965 375 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO3P24031 467 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PUP1P25043 261 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RNA15P25299 296 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR099CP25657 155 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MGT1P26188 188 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GAR1P28007 205 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PDB1P32473 366 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS17P32913 551 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SLC1P33333 303 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL100CP34248 587 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MAE1P36013 669 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PRS4P38063 326 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B REV7P38927 245 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B HOS4P40480 1083 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RLP7P40693 322 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GAB1P41733 394 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MEP2P41948 499 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR210CP42942 411 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PRM10P42946 383 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AGP3P43548 558 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG18P43601 500 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YFR054CP43622 192 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRS85P46944 698 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MAD3P47074 515 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NIT3P49954 291 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AIF1P52923 378 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR045CP53229 120 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR111WP53265 400 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B NOP15P53927 220 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ASI3P53983 676 aa0.49□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RIM13Q03792 727 aa0.49□□□□□ -2.33
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