RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	EFM1	P38732	585 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	PCL7	P40186	285 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	ASG7	P46993	209 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	RTT102	P53330	157 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YPL080C	Q02826	108 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YDR222W	Q04925	415 aa		0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	KRE1	P17260	313 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	TCB2	P48231	1178 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	SLM3	Q12093	417 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	MED6	P38782	295 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	RRG9	P40156	214 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	MOB2	P43563	287 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	SUR7	P54003	302 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	DXO1	Q06349	442 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	ARR1	Q06596	294 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YDL121C	Q07541	149 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	UAF30	Q08747	228 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YPL264C	Q08980	353 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	SCM3	Q12334	223 aa		0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	MRPL8	P22353	238 aa		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	CPR2	P23285	205 aa		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YMR244W	Q04018	355 aa		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	CSI1	Q04368	295 aa		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	AAD15	Q08361	143 aa		0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	INO2	P26798	304 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	ZRT3	P34240	503 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	RCK1	P38622	512 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YFR018C	P43599	363 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YFR045W	P43617	309 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	VPS72	Q03388	795 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	INP1	Q03694	420 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	TRM82	Q03774	444 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	PEX30	Q06169	523 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	NDL1	Q06568	189 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	CTA1	P15202	515 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	URA10	P30402	227 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YER084W	P40057	128 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YCH1	P42937	148 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	YDR114C	Q04597	100 aa		0.72	□□□□□ -2.29
VIK1	YPL253C	MED8	P38304	223 aa		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YGR111W	P53265	400 aa		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YDR541C	Q03049	344 aa		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	SHS1	Q07657	551 aa		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ALE1	Q08548	619 aa		0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	VPS63	O13549	108 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	PDE2	P06776	526 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	IST2	P38250	946 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YHR177W	P38867	453 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YIL054W	P40524	105 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MIC19	P43594	170 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	CAX4	P53223	239 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MDM1	Q01846	1127 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	FEX1	Q08913	375 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	FEX2	Q08991	375 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YKL071W	P36086	256 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	UBA3	Q99344	299 aa		0.7	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ZIM17	P42844	174 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ECO1	P43605	281 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YNL095C	P53932	642 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MEH1	Q02205	184 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	DCI1	Q08558	271 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MRX4	Q12467	430 aa		0.69	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	VAM7	P32912	316 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	PEX5	P35056	612 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YHR182W	P38870	785 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ITR2	P30606	609 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	LTV1	P34078	463 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MNL1	P38888	796 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	HIT1	P46973	164 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	IES3	Q12345	250 aa		0.68	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	PDX1	P16451	410 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	CTM1	P38818	585 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YGL118C	P53132	145 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	FMP48	P53233	369 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	IPK1	Q06667	281 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	TAF10	Q12030	206 aa		0.67	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.66	□□□□□ -2.3	not detected
VIK1	YPL253C	FAR1	P21268	830 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YER188W	P40103	239 aa		0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
VIK1	YPL253C	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.66	□□□□□ -2.3

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