RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	SMK1	P41808	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SER2	P42941	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	AAD10	P47182	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MSE1	P48525	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	IMO32	P53219	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YAT1	P80235	687 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MSS11	Q03825	758 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SMA2	Q04658	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PEX10	Q05568	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	GLO4	Q12320	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	SIR2	P06700	562 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ERD2	P18414	219 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FPS1	P23900	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ERG4	P25340	473 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PTC6	P25646	442 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MDL1	P33310	695 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ECM15	P35195	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RSM22	P36056	628 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YBR137W	P38276	179 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPP1	P38786	293 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TRR2	P38816	342 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	VPS52	P39904	641 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	DIE2	P50076	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	PFA5	Q03289	374 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	HLR1	Q04429	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YML053C	Q04978	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	DFG16	Q99234	619 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL21B	YPL079W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YPK2	P18961	677 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	CWP1	P28319	239 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	HOG1	P32485	435 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	TIM12	P32830	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YPT7	P32939	208 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	SUR1	P33300	382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YOR062C	P36025	268 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	THI2	P38141	450 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	OCA5	P38738	679 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	CHS7	P38843	316 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YIL165C	P40446	119 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YKE4	P40544	346 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	NAS2	P40555	220 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	GDS1	P41913	522 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YFR054C	P43622	192 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	ERV29	P53337	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	RRN9	P53437	365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YNR062C	P53748	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	PLB2	Q03674	706 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	GRX3	Q03835	250 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	URC2	Q04411	772 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	SSK1	Q07084	712 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	PCL9	Q12477	304 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	AI1	P03875	834 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	HAP4	P14064	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	ATG22	P25568	528 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	IMG1	P25626	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	BET3	P36149	193 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	SKN7	P38889	622 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
RPL21B	YPL079W	BUR6	P40096	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	LEM3	P42838	414 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL21B	YPL079W	TRM9	P49957	279 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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