RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
RPS31	YLR167W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	PRR1	P28708	518 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	RPC25	P35718	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	PEX18	P38855	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	FET3	P38993	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	GTO1	P48239	356 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	BNS1	P50084	137 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	SHY1	P53266	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	MFG1	Q07684	458 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	IZH2	Q12442	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS31	YLR167W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	HXT1	P32465	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YKL162C	P36052	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	ATG18	P43601	500 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	MKC7	P53379	596 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	BCP1	Q06338	283 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SLM3	Q12093	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	LDB17	Q12342	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YKL070W	P36087	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	EGT2	P42835	1041 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	BIR1	P47134	954 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	OKP1	P53298	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	TRM82	Q03774	444 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SFM1	Q12314	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	HMS1	Q12398	434 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YPR1	Q12458	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RCK2	P38623	610 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YER186C	P40101	306 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	CRH1	P53301	507 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YNL260C	P53846	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	FRE8	Q12209	686 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	ITR2	P30606	609 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	PET100	P38958	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YFL040W	P43562	540 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	COX16	P47081	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	MND1	P53102	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	BIO4	P53630	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SIA1	Q12212	622 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	MCT1	Q12283	360 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RPN6	Q12377	434 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	GIT1	P25346	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	LDS1	P31379	325 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	ECT1	P33412	323 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	DFG10	P40526	253 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YNL320W	P42840	284 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YGL185C	P53100	379 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SUR7	P54003	302 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	DDC1	Q08949	612 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YMR262W	P38430	313 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YHR035W	P38769	630 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	SMF2	P38778	549 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	FHL1	P39521	936 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	ATP16	Q12165	160 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RPS31	YLR167W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	SAL1	D6W196	494 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	MEI5	P32489	222 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	PMT4	P46971	762 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	HCH1	P53834	153 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	VAC7	P53950	1165 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	YET2	Q04210	160 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	FSH2	Q05015	223 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	FMP16	Q12497	93 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	REP1	P03871	373 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	STE7	P06784	515 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	GPI12	P23797	304 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	PMT2	P31382	759 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	DEP1	P31385	405 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	SWD3	P38123	315 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	DSE1	P40077	573 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	GAB1	P41733	394 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RPS31	YLR167W	MOB2	P43563	287 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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