RNA–Protein interactions for RNA: YLL039C

UBI4, Transcript of Ubiquitin, yeast

Gene UBI4, Length 1,146 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBI4	YLL039C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ARP10	Q04549	284 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	GAD1	Q04792	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	COX20	Q04935	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	VID22	Q05934	901 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FMP45	Q07651	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SNF8	Q12483	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ARG81	P05085	880 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SIR3	P06701	978 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	HOM3	P10869	527 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	UNG1	P12887	359 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DMC1	P25453	334 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MXR2	P25566	168 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RSM22	P36056	628 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	IST2	P38250	946 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YHR218W	P38899	603 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	VMA7	P39111	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SEN34	P39707	275 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	KRE29	P40026	464 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FAU1	P40099	211 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YIL152W	P40455	235 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	HPM1	P40481	377 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	STE24	P47154	453 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	PMT3	P47190	753 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CGR1	P53188	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ASI2	P53895	289 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	REC102	Q02721	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YML122C	Q03207	126 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	HSP31	Q04432	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	NTG2	Q08214	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FEX1	Q08913	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MLH3	Q12083	715 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ACF2	Q12168	779 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RPN6	Q12377	434 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RPN13	O13563	156 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ARG3	P05150	338 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MSS18	P08593	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SNF4	P12904	322 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DBF2	P22204	572 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SCO2	P38072	301 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	AIM2	P39721	246 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FMP52	P40008	231 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ICE2	P40499	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	FAR7	P43592	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	PMT4	P46971	762 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YJL043W	P47053	257 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RSC9	Q03124	581 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RSM10	Q03201	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	COA4	Q05809	96 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DCS1	Q06151	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	GMC2	Q06201	188 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DXO1	Q06349	442 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	COS7	Q07788	383 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YEH1	Q07804	573 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RAX1	Q08760	435 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	PSY3	Q12318	242 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ATG31	Q12421	196 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	COX1	P00401	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CAP2	P13517	287 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ENA1	P13587	1091 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CDC26	P14724	124 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SAN1	P22470	610 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	APN1	P22936	367 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YCL049C	P25577	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	PEX3	P28795	441 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ACH1	P32316	526 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	NUP2	P32499	720 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	DSS1	P39112	969 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MBP1	P39678	833 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	GET1	P53192	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	COS1	P53822	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YNL095C	P53932	642 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RHO4	Q00246	291 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	PEX25	Q02969	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RAD33	Q04231	177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	RNH1	Q04740	348 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	MUM3	Q08750	479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBI4	YLL039C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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