RNA–Protein interactions for RNA: YKL154W

SRP102, Transcript of Signal recognition particle (SRP) receptor beta subunit, yeast

Gene SRP102, Length 735 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRP102	YKL154W	GPI8	P49018	411 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YGR066C	P53242	292 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YGR168C	P53293	376 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SPR6	Q01684	191 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YKR011C	Q02209	353 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SNX41	Q04053	625 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	COX20	Q04935	205 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	NDL1	Q06568	189 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YDL109C	Q12103	647 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YOL087C	Q99247	1116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YOL163W	P0CF20	169 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	MCM1	P11746	286 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	ITR2	P30606	609 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YNL195C	P40168	261 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	NIT2	P47016	307 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	LYS5	P50113	272 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	RMR1	P53060	241 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	MEP3	P53390	489 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YNL092W	P53934	400 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	HFD1	Q04458	532 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	RNH202	Q05635	350 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YPL191C	Q08930	360 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YDL176W	Q12027	708 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	VIK1	Q12045	647 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SWM1	Q12379	170 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	FLO9	P39712	1322 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YEF1	P32622	495 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SLC1	P33333	303 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YPL039W	Q03080	316 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	GAS2	Q06135	555 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	AVO1	Q08236	1176 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	MCP1	Q12106	302 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	BLM10	P43583	2143 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	CTA1	P15202	515 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	PRP28	P23394	588 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	EHD3	P28817	500 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.4	□□□□□ -1.22	not detected
SRP102	YKL154W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YIL166C	P40445	542 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	HXT9	P40885	567 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	ERP6	P53198	216 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	BUD9	P53226	547 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	HXT11	P54862	567 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	SYO1	Q07395	620 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	WTM2	Q12206	467 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	DFG16	Q99234	619 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SRP102	YKL154W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	RHB1	P25378	209 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	HSP30	P25619	332 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	UBC8	P28263	218 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	SNC1	P31109	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	JEN1	P36035	616 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	COG3	P40094	801 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	XBP1	P40489	647 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	FAR7	P43592	221 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	ALG12	P53730	551 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	IRC19	Q07843	230 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	CRT10	Q08226	957 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	RSA1	Q08932	381 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	HER1	Q12276	1246 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	SIR3	P06701	978 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	TIM12	P32830	109 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	FET3	P38993	636 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	FMP33	P46998	180 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	MRK1	P50873	501 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	TFB3	Q03290	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	BTS1	Q12051	335 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	YAK1	P14680	807 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	YPK2	P18961	677 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	NUP1	P20676	1076 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	UTR1	P21373	530 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	MDH2	P22133	377 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	NFS1	P25374	497 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	CTF8	P38877	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	SKN7	P38889	622 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	YAR028W	P39548	234 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	PRY1	P47032	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	YJR098C	P47139	656 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	ILM1	P47155	203 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SRP102	YKL154W	YGR126W	P53274	230 aa		7.37	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.2 ms