RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C RXT2P38255 430 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FHL1P39521 936 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C STB1P42845 420 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C COQ5P49017 307 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SLM3Q12093 417 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C UBA3Q99344 299 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ESP1Q03018 1630 aa2.15□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SIN3P22579 1536 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C QCR6P00127 147 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RRT13P40042 185 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YNR068CP53754 272 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YOL075CQ08234 1294 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C DDC1Q08949 612 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YOL085CQ99345 113 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C BPT1P14772 1559 aa2.14□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MLP2P40457 1679 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FMT1P32785 401 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MOB2P43563 287 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C EFM3P47163 339 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C LST7P53237 242 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C TRM82Q03774 444 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SMP3Q04174 516 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FRE8Q12209 686 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PDR10P51533 1564 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C POL1P13382 1468 aa2.13□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RKR1Q04781 1562 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C BUD4P47136 1447 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ECM5Q03214 1411 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MAS1P10507 462 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C DAP2P18962 818 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C GRR1P24814 1151 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ZIP1P31111 875 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C DAD2P36162 133 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ATG7P38862 630 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FRT2P39734 528 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C EOS1P53938 366 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YPS3Q12303 508 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SFG1Q12507 346 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MYO4P32492 1471 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SCC2Q04002 1493 aa2.12□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C AUS1Q08409 1394 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C STE2D6VTK4 431 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C THR4P16120 514 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C CKI1P20485 582 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C GGC1P38988 300 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RBG1P39729 369 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SUR7P54003 302 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SED5Q01590 340 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RCF1Q03713 159 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C API2Q04413 109 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YOL029CQ08187 201 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C APC5Q08683 685 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MMT2Q08970 484 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C GLE1Q12315 538 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C FRE6Q12473 712 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SKS1Q12505 502 aa2.11□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C URA10P30402 227 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C HMX1P32339 317 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MRPS5P33759 307 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C IST2P38250 946 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RCK2P38623 610 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YNL320WP42840 284 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SCS7Q03529 384 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C CSM3Q04659 317 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C MRX8Q05473 314 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C ALE1Q08548 619 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YOR012WQ12351 137 aa2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YOR1P53049 1477 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RDS1P25611 832 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C CYM1P32898 989 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C PRY2P36110 329 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YIR035CP40579 254 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C YHC3P47040 408 aa2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
CSE4YKL049C HST4P53688 370 aa2.09□□□□□ -2.07
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