RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	ECM34	P38728	170 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ANS1	P38832	159 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	CHL4	P38907	458 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	APS3	P47064	194 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	MDE1	P47095	244 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YGL235W	P53071	178 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	TPC1	P53257	314 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	MKC7	P53379	596 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YLR173W	Q06247	608 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YPS7	Q06325	596 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	AI1	P03875	834 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PHO80	P20052	293 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SRL3	P36167	246 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	HSP30	P25619	332 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	KAP122	P32767	1081 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	MRPL15	P36523	253 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	FMP52	P40008	231 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YNL195C	P40168	261 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	GDS1	P41913	522 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	STB1	P42845	420 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SPT20	P50875	604 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PLM2	Q04383	521 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SYO1	Q07395	620 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SEC12	P11655	471 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ERD1	P16151	362 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	MTC2	P34246	357 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YKL077W	P36081	392 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YIL166C	P40445	542 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	ICE2	P40499	491 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YIL086C	P40503	102 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PEX10	Q05568	337 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	DAL82	P21705	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PUP2	P32379	260 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	YBR063C	P38083	404 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SHE1	P38200	338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	EXO84	P38261	753 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	RPS27B	P38711	82 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	PZF1	P39933	429 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SKM1	Q12469	655 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RTC3	YHR087W	SNC1	P31109	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	IFA38	P38286	347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	MBA1	P38300	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YIL152W	P40455	235 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YJR098C	P47139	656 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YGR266W	P53326	701 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	FDC1	Q03034	503 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YPR127W	Q06494	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	CDA2	Q06703	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	BSC6	Q08280	497 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YDR061W	Q12298	539 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	MMP1	Q12372	583 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	RAS1	P01119	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	BAR1	P12630	587 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	DCG1	P32460	244 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	RSM22	P36056	628 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	RTC2	P38279	296 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YHK8	P38776	514 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	SER2	P42941	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	PGA1	P53896	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	INP1	Q03694	420 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	HAP4	P14064	554 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	PTC6	P25646	442 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	ZRT3	P34240	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	MCM7	P38132	845 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.87	□□□□□ -0.19	not detected
RTC3	YHR087W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	IPK1	Q06667	281 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YPL278C	Q08990	100 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	DFG16	Q99234	619 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	PRP28	P23394	588 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	MXR2	P25566	168 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	SPT14	P32363	452 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	UBS1	P38290	277 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	CFD1	P40558	293 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	NCE101	Q02820	53 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RTC3	YHR087W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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