RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	RTT102	P53330	157 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MEH1	Q02205	184 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ERO1	Q03103	563 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RMT2	Q03305	412 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YMR010W	Q03687	405 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	API2	Q04413	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	NDL1	Q06568	189 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YOL029C	Q08187	201 aa		0.42	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STU1	P38198	1513 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
NNF2	YGR089W	COX10	P21592	462 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YHR177W	P38867	453 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GGC1	P38988	300 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BDH1	P39714	382 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	UFE1	P41834	346 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AIM23	P47015	356 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SLT2	Q00772	484 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SCS7	Q03529	384 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YLH47	Q06493	454 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SLM3	Q12093	417 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BCK1	Q01389	1478 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	BUD3	P25558	1636 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YPR096C	O13587	100 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	PDE2	P06776	526 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CKA2	P19454	339 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TIP20	P33891	701 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	EFM3	P47163	339 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDR541C	Q03049	344 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	VPS72	Q03388	795 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	GAS2	Q06135	555 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	AAD15	Q08361	143 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	DCI1	Q08558	271 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.41	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	TAF2	P23255	1407 aa		0.4	□□□□□ -2.34
NNF2	YGR089W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	DAL5	P15365	543 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	UTR5	P32630	166 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SWE1	P32944	819 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	LTV1	P34078	463 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YMR262W	P38430	313 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MNL1	P38888	796 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	RBG1	P39729	369 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YJR030C	P47101	745 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	NAS6	P50086	228 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	PRM1	P53835	661 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MMT2	Q08970	484 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YDR018C	Q12185	396 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	GPM3	Q12326	303 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	TOR1	P35169	2470 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	CUP2	P15315	225 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MRPL8	P22353	238 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	PPQ1	P32945	549 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	JNM1	P36224	373 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SUR7	P54003	302 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	TRM82	Q03774	444 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	VTI1	Q04338	217 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	APC4	Q04601	652 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	FRE8	Q12209	686 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YOR338W	Q99326	363 aa		0.4	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	CPT1	P17898	393 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	RPB9	P27999	122 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	TKL2	P33315	681 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YKR015C	P36111	568 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MLH1	P38920	769 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SCC4	P40090	624 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MOB2	P43563	287 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	GTO3	Q04806	366 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	IPK1	Q06667	281 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	YPR078C	Q06813	372 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SHS1	Q07657	551 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	ISA2	Q12425	185 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SRB8	P25648	1427 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	FAR1	P21268	830 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	VAM7	P32912	316 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	TAE1	P38340	232 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	ECM14	P38836	430 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	RRG9	P40156	214 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	LCB2	P40970	561 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	MIX17	Q03667	156 aa		0.39	□□□□□ -2.35
NNF2	YGR089W	GMC1	Q04399	608 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms