RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	GPG1	P53130	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YGR035C	P53222	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	FMP48	P53233	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	MTQ1	P53944	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ASI3	P53983	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	DCS1	Q06151	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BSP1	Q06604	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ATG41	Q12048	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BSC1	Q12140	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CDC9	P04819	755 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CDC23	P16522	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	AAC3	P18238	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	UTR1	P21373	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	APN1	P22936	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CNB1	P25296	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CPR3	P25719	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PMT2	P31382	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	MTH1	P35198	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	GMH1	P36125	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ECM31	P38122	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	DTR1	P38125	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PAU24	P38155	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SRO77	P38163	1010 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	COS8	P38723	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	OSH7	P38755	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ALP1	P38971	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	JHD1	P40034	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	APQ12	P40532	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	TED1	P40533	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CAT5	P41735	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RPE1	P46969	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	LOH1	P47055	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PPT1	P53043	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	COS12	P53053	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CGR1	P53188	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PAU12	P53343	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PGA1	P53896	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PLM2	Q04383	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BOP2	Q06150	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SSK1	Q07084	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RSC58	Q07979	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CRT10	Q08226	957 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	AEP3	Q12089	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SPC3	Q12133	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	WHI5	Q12416	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	REP2	P03872	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	STE7	P06784	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ARG80	P07249	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SEC12	P11655	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ECM25	P32525	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SRB6	P32570	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	ORC2	P32833	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YKL077W	P36081	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RRN10	P38204	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	CCZ1	P38273	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SDH8	P38345	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	LAG1	P38703	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	NSG1	P38837	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	MAD2	P40958	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	IDS2	P46958	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	BFA1	P47113	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PEX21	P50091	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SAM37	P50110	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	PMT5	P52867	743 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	DOC1	P53068	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SGF73	P53165	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	COG7	P53195	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SAY1	P53324	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	SSY1	Q03770	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL28	YGL103W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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