RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ECM8P38246 354 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YBR242WP38331 238 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YHR131CP38835 850 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W AIM18P38884 321 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ATM1P40416 690 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RMI1Q02685 241 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GAL83Q04739 417 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W VTA1Q06263 330 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W NRT1Q08485 598 aa4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ECM29P38737 1868 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W THP2O13539 261 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DBF2P22204 572 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PPZ1P26570 692 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MMS4P38257 691 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YHR218WP38899 603 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PAC11P40960 533 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DLD2P46681 530 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W AIM23P47015 356 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BIR1P47134 954 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MSS11Q03825 758 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GPI11Q06636 219 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MDY2Q12285 212 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W COX4P04037 155 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YCR043CP25361 127 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W TVP38P36164 337 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MDE1P47095 244 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W HOC1P47124 396 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W KEL2P50090 882 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BIO3P50277 480 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W CLD1P53264 445 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SLM2P53955 656 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SAM50P53969 484 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GAS3Q03655 524 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YLR281CQ05863 155 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YLR352WQ06479 807 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W CDD1Q06549 142 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SYO1Q07395 620 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PGC1Q08959 321 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SAS5Q99314 248 aa4.39□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W CHS1P08004 1131 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BAR1P12630 587 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SEN2P16658 377 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W STF2P16965 84 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W HNM1P19807 563 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PHO84P25297 587 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W HSP30P25619 332 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ADK2P26364 225 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ARO7P32178 256 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W STB6P36085 766 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MRPL17P36528 281 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SLX1P38324 304 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RBG1P39729 369 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RPH1P39956 796 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W TES1P41903 349 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ALG11P53954 548 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DML1Q03652 475 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W TAF12Q03761 539 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SNA4Q07549 140 aa4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W CIN8P27895 1000 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BEM1P29366 551 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W UTR4P32626 227 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YHK8P38776 514 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W VMA7P39111 118 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YHB1P39676 399 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W COA1P40452 197 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W COS4P43542 379 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GLG2P47011 380 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YJL132WP47014 750 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MRPL50P53724 139 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BCH1Q05029 724 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W BNA5Q05979 453 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RIF2Q06208 395 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PDE2P06776 526 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RAD7P06779 565 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SAR1P20606 190 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W DBR1P24309 405 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PHO91P27514 894 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W APE2P32454 952 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W SMI1P32566 505 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GPX2P38143 162 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ARN2P38724 620 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MTW1P39731 289 aa4.37□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GCD10P41814 478 aa4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.1 ms