RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	TFS1	P14306	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SAM35	P14693	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BET2	P20133	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LDS1	P31379	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ATP11	P32453	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PTR2	P32901	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MKS1	P34072	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GMH1	P36125	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BET3	P36149	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SOL2	P37262	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	UBA4	P38820	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HPA3	P39979	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FMP52	P40008	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MPM1	P40364	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MEP2	P41948	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	IRC7	P43623	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AIM24	P47127	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HXT16	P47185	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FDC1	Q03034	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	UTR1	P21373	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	NDC1	P32500	655 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	VPS17	P32913	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MIA40	P36046	403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BMT2	P38278	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YHR033W	P38690	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	LAG1	P38703	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IKI1	P38874	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
PDI1	YCL043C	RRG9	P40156	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YGR015C	P53208	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ERV29	P53337	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AAT1	Q01802	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	CCE1	Q03702	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	EMI1	Q04406	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SPO77	Q06134	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	DIN7	Q12086	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	DCN1	Q12395	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HIS5	P07172	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YSR3	P23501	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	HCM1	P25364	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YCR102C	P25608	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	OAC1	P32332	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	KRE6	P32486	720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	VAM7	P32912	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AFR1	P33304	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ERV15	P38312	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	BAP3	P41815	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MOG1	P47123	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YJR149W	P47177	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MDM34	P53083	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	NPY1	P53164	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YNL260C	P53846	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	INN1	P53901	409 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AQR1	P53943	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IRC15	Q02733	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ARL3	Q02804	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MET31	Q03081	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	GAS2	Q06135	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	TPO3	Q06451	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	ATG10	Q07879	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PSF1	Q12488	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SRN2	Q99176	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IRA2	P19158	3079 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	AAC1	P04710	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	UNG1	P12887	359 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MSN1	P22148	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	MCM10	P32354	571 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	YPT7	P32939	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	EMC3	P36039	253 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	TAE1	P38340	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PDI1	YCL043C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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