RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TOP1MT	Q969P6	601 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MTBP	Q96DY7	904 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR24	Q96S15	920 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KCNK16	Q96T55	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	POLI	Q9UNA4	740 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NEBL	O76041	1014 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MYL6B	P14649	208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PCK1	P35558	622 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	INA	Q16352	499 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SNF8	Q96H20	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FAR2	Q96K12	515 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SEPT3	Q9UH03	358 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KRIT1	O00522	736 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CYTH3	O43739	400 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PDE8B	O95263	885 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CTDNEP1	O95476	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PAX3	P23760	479 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	POLD2	P49005	469 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RPS6KA3	P51812	740 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PDE1B	Q01064	536 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KLC1	Q07866	573 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PACS2	Q86VP3	889 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	JAML	Q86YT9	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SCFD2	Q8WU76	684 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KRT35	Q92764	455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350		F8VZ95	297 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MAFG	O15525	162 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GYPC	P04921	128 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	SERPINB5	P36952	375 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PTK6	Q13882	451 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NTRK3	Q16288	839 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	EHD1	Q9H4M9	534 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TLE6	Q9H808	572 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	APPL1	Q9UKG1	709 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRPC6	Q9Y210	931 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF487	B1APH4	448 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CBFA2T3	O75081	653 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PEX14	O75381	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	PTEN	P60484	403 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MXRA7	P84157	204 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	CDC16	Q13042	620 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CACNB4-222	ENST00000636350	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms