RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.56□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 B4E1Z4 1266 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FSCN2O14926 492 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRTAMO95727 393 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NLRP12P59046 1061 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NTRK3Q16288 839 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAD18Q9NS91 495 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAI14Q9P0K7 980 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 WHRNQ9P202 907 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 A0A1B0GUL6 1792 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTC28Q96AY4 2481 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NRDCO43847 1150 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MT-CO1P00395 513 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 APPP05067 770 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 TM4SF4P48230 202 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 PICALMQ13492 652 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MORC3Q14149 939 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NKG7Q16617 165 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FAM83AQ86UY5 434 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPATA5Q8NB90 893 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP33Q8TEY7 942 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 WNT8BQ93098 351 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 OPTNQ96CV9 577 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 TEPSINQ96N21 525 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 WRNIP1Q96S55 665 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 WDR18Q9BV38 432 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FANCGO15287 622 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 AVPP01185 164 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 PF4V1P10720 104 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 INHBEP58166 350 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ERVK-24P63145 666 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 GSTO1P78417 241 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 VGLL4Q14135 290 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 USP53Q70EK8 1073 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SSH3Q8TE77 659 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPM1EQ8WY54 764 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCYL1Q96KG9 808 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 KLF15Q9UIH9 416 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4DIP-241ENST00000616206 LDHCP07864 332 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ITGA4P13612 1032 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ECI1P42126 302 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 BTDP43251 543 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 DGKGP49619 791 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 RGS3P49796 1198 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 GFRA1P56159 465 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ID3Q02535 119 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 MECOMQ03112 1051 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 NFIAQ12857 509 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 CEP85Q6P2H3 762 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4DIP-241ENST00000616206 PJA1Q8NG27 643 aa8.52□□□□□ -1.05
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