RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCND2Q9NZV8 630 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SALL4Q9UJQ4 1053 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLIC2O15247 247 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KSR1Q8IVT5 923 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRACR2AQ9BSW2 395 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NR3C1P04150 777 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCND2P30279 289 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ODR4Q5SWX8 454 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RUBCNQ92622 972 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DRC1Q96MC2 740 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEF6Q9H4E7 631 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.34■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKR1B10O60218 316 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIP1RO75146 1068 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NR3C2P08235 984 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF131P52739 623 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFRKBQ6P4R8 1299 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDXDC1Q6P996 788 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PADI6Q6TGC4 694 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SULF1Q8IWU6 871 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GUCY2CP25092 1073 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FIZ1Q96SL8 496 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEL1LQ9UBV2 794 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HYOU1Q9Y4L1 999 aa26.33■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR90Q96KV7 1748 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM66O15016 1216 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGEA1P43355 309 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UGCGQ16739 394 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HGSNATQ68CP4 663 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACAD9Q9H845 621 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TGFB1I1O43294 461 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP3O75969 853 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNH2Q12809 1159 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC70Q6NSX1 233 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HINFPQ9BQA5 517 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYH11P35749 1972 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCNE2O96020 404 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASP4P49662 377 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TREML2Q5T2D2 321 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF720Q7Z2F6 126 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP39A1Q9NYL5 469 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM150BA6NC51 233 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP2A1O14983 1001 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APBA1Q02410 837 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK7Q13164 816 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAW1Q8N136 415 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSADQ9Y600 493 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RARRES1P49788 294 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLR10Q9BXR5 811 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR64B1ANS9 1081 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PEX10O60683 326 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXCR5P32302 372 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EHD2Q9NZN4 543 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCK2O43639 380 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOL4O94818 638 aa26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms