RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574085.5

TRPV1-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, human

TSL 2

Gene TRPV1, Length 2,644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPV1-208	ENST00000574085	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	IL2RB	P14784	551 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CCNG1	P51959	295 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	USP4	Q13107	963 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	PIGB	Q92521	554 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	SLC37A4	O43826	429 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	GNA11	P29992	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ADAM9	Q13443	819 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MKL1	Q969V6	931 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM170A	A1A519	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	KRT13	P13646	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ECM1	Q16610	540 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TDP2	O95551	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	PRKCI	P41743	596 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MECOM	Q03112	1051 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	PLS1	Q14651	629 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	EPAS1	Q99814	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MAF1	Q9H063	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	HIP1R	O75146	1068 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	GJB6	O95452	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	GALC	P54803	685 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	NPEPPS	P55786	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	MAPK7	Q13164	816 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085		O00370	1275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRPV1-208	ENST00000574085	RIPK2	O43353	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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