RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568153.1

CAPN3-218, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-218ENST00000568153 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CSADQ9Y600 493 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CNTNAP1P78357 1384 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 A0A1W2PQ27 194 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 A0A1W2PQ64 194 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 A0A1W2PQD8 194 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SHTN1A0MZ66 631 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 HMX2A2RU54 273 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 DCDC2CA8MYV0 355 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CYTH3O43739 400 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 PPP6R2O75170 966 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GH2P01242 217 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CMA1P23946 247 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GNA11P29992 359 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ASPAP45381 313 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 USP11P51784 963 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ICA1Q05084 483 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF543Q08ER8 600 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 LRFN4Q6PJG9 635 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MIGA2Q7L4E1 593 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 BLIDQ8IZY5 108 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GPC2Q8N158 579 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC148Q8NFR7 591 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 DCAF4Q8WV16 495 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 HOOK2Q96ED9 719 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 C6orf50Q9HD87 102 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 BARHL2Q9NY43 387 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 RNF112Q9ULX5 631 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 FSD2A1L4K1 749 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SMCO2A6NFE2 343 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TRIM75PA6NK02 468 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 F5H6K3 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CUTAO60888 179 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 BMP15O95972 392 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 IGLV1-40P01703 118 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ATP2B1P20020 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 RAB6AP20340 208 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GARTP22102 1010 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CAP2P40123 477 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SLC1A4P43007 532 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TRAPPC10P48553 1259 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MRE11P49959 708 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ERVK-24P63145 666 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 RING1Q06587 406 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 KLRC3Q07444 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 TTLL4Q14679 1199 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CAPN3-218ENST00000568153 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF394Q53GI3 561 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 BEND4Q6ZU67 534 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 C12orf40Q86WS4 652 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 PIGSQ96S52 555 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GINM1Q9NU53 330 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 DACT1Q9NYF0 836 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 HACL1Q9UJ83 578 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 SYCE3A1L190 88 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 STXBP3O00186 592 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 ZBTB5O15062 677 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 CTAGE5O15320 804 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPN3-218ENST00000568153 GSC2O15499 205 aa6.98□□□□□ -1.29
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