RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	STAM	Q92783	540 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH7	P12883	1935 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617		C9IYK1	514 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	INPPL1	O15357	1258 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PLA2G6	O60733	806 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GGPS1	O95749	300 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CTSA	P10619	480 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC16A2	P36021	539 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CHGB	P05060	677 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC1A4	P43007	532 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	KRT10	P13645	584 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PAK2	Q13177	524 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZS52	159 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	FZD8	Q9H461	694 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PRDM1	O75626	825 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MBD4	O95243	580 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GNAT1	P11488	350 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAM2	Q99965	735 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TTLL1	O95922	423 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	CHRNB1	P11230	501 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GP1BB	P13224	206 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCG1	P45844	678 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	RALBP1	Q15311	655 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	MEIS3	Q99687	375 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.27	□□□□□ -0.28
ABCD4-222	ENST00000555617	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CSRP3	P50461	194 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NTHL1	P78549	312 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PFKP	Q01813	784 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	STXBP2	Q15833	593 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29

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