RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 COG2Q14746 738 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC125Q86Z20 511 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM165Q9HC07 324 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MYH8P13535 1937 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PQC6 194 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PPFIA4O75335 1185 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TACC1O75410 805 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE8P0CG41 777 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SMTNP53814 917 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 DEUP1Q05D60 604 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KCNH2Q12809 1159 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 GNPTABQ3T906 1256 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PADI6Q6TGC4 694 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 WDR18Q9BV38 432 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 GBP3Q9H0R5 595 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.53□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC53A6NM62 1247 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D12O60347 775 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NR3C1P04150 777 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LMNB1P20700 586 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ6P48051 423 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PEX3P56589 373 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SLC8A3P57103 927 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 Q4G0T1 1027 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 WLSQ5T9L3 541 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.52□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SCN9AQ15858 1988 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CNTNAP1P78357 1384 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GAP43P17677 238 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FLT3P36888 993 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK-24P63145 666 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GIT2Q14161 759 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 EPHA7Q15375 998 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PTPROQ16827 1216 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 DLK2Q6UY11 383 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 OTOP1Q7RTM1 612 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CEP170P1Q96L14 293 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 TCHPQ9BT92 498 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 LAMB1P07942 1786 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 BUB1O43683 1085 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CASP5P51878 434 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 USP4Q13107 963 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ASIC2Q16515 512 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 IL31RAQ8NI17 732 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA1Q92805 767 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 BATF3Q9NR55 127 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.52□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0U1RQJ8 604 aa8.51□□□□□ -1.05
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