RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM228AQ86W67 206 aa29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 MTRQ99707 1265 aa29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.93■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 RFXAPO00287 272 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 LAD1O00515 517 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ASAP2O43150 1006 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DARSP14868 501 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 TMX1Q9H3N1 280 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 RGS18Q9NS28 235 aa29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 LYPLA2O95372 231 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGRE1Q14246 886 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 EMC2Q15006 297 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 NACC1Q96RE7 527 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DACT1Q9NYF0 836 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 LRWD1Q9UFC0 647 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa29.91■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 MYO9BQ13459 2157 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A087WZ62 844 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF15O94989 841 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 PTGDRQ13258 359 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DRP2Q13474 957 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPROQ16827 1216 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM143Q96AN5 459 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP89Q96ST8 783 aa29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DGAT1O75907 488 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 GRB10Q13322 594 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 TFDP1Q14186 410 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 DTHD1Q6ZMT9 781 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM192Q8IY95 271 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 LINC01599Q8WXQ3 324 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa29.89■■■□□ 2.38
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXA2O43364 376 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 DGKIO75912 1065 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CTNNB1P35222 781 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PDIA5Q14554 519 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 NBR1Q14596 966 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 EPC2Q52LR7 807 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ABI1Q8IZP0 508 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PIGOQ8TEQ8 1089 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.88■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CHST12Q9NRB3 414 aa29.87■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBTB39O15060 712 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MGEA5O60502 916 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RPA1P27694 616 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CUL4AQ13619 759 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 KRT79Q5XKE5 535 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF169Q8NCN4 708 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM161AQ9NX61 479 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR81Q562E7 1941 aa29.86■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 EPOPA6NHQ4 379 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RB1P06400 928 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SKIP12755 728 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 MUTP22033 750 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FGFR4P22455 802 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 PHKA2P46019 1235 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 GPM6BQ13491 265 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 KSR1Q8IVT5 923 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 AAASQ9NRG9 546 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 SIP14410 1827 aa29.85■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 C9IYK1 514 aa29.84■■■□□ 2.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
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