RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PDP2Q9P2J9 529 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GJD2Q9UKL4 321 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 L1RE1Q9UN81 338 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 H0Y8X5 98 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FIBPO43427 364 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NDUFS2O75306 463 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KRT37O76014 449 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 UBXN7O94888 489 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RHOBTB3O94955 611 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 AGR2O95994 175 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PAMP19021 973 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFAIP3P21580 790 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ENPP1P22413 925 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PPM1AP35813 382 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MTNR1BP49286 362 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 IRF9Q00978 393 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MYBPC2Q14324 1141 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR19Q15760 415 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PGS1Q32NB8 556 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC93Q567U6 631 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CFAP161Q6P656 301 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KRT77Q7Z794 578 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NME9Q86XW9 330 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LRTOMTQ8WZ04 291 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ARL8AQ96BM9 186 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RAX2Q96IS3 184 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 IPPKQ9H8X2 491 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CERS4Q9HA82 394 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 POLHQ9Y253 713 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RHPN2P1A8MT19 583 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 H3BS24 57 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 K7ENM7 598 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MAFKO60675 156 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MSCO60682 206 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SNX2O60749 519 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SLITRK5O94991 958 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 VDRP11473 427 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PLS3P13797 630 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC9A1P19634 815 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 C5AR1P21730 350 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TECP42680 631 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RXRGP48443 463 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KIF11P52732 1056 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPSM2P81274 684 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SPIRE1Q08AE8 756 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LSAMPQ13449 338 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC96Q2M329 555 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC38Q502W7 563 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FAAH2Q6GMR7 532 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MPZL3Q6UWV2 235 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RFX8Q6ZV50 586 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 OTOP3Q7RTS5 596 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR155Q7Z3F1 870 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 DAAM2Q86T65 1068 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CDH24Q86UP0 819 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SKAP1Q86WV1 359 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MFSD4AQ8N468 514 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR18Q8N4B5 295 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MYCT1Q8N699 235 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PHKBQ93100 1093 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KIRREL1Q96J84 757 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 HSPA12BQ96MM6 686 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms